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询问 SPONGE 输入文件（mdin.spg.toml）的参数配置时使用。 适用于模拟参数设置、模块配置、输入输出文件指定等。
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استنادا إلى تصنيف SOC المهني
询问 SPONGE benchmark 新建 或 调整 时 使用 - comparison validation performance 分类 - benchmark 目录 组织 - benchmark 测试 编写 - utils 复用 - pixi task 接入
询问 SPONGE 构建、编译、环境配置、构建排错时使用。 适用于 pixi 环境选择、CMake 配置、多后端编译、格式化、打包。
询问 SPONGE 代码风格、命名规范、格式化工具时使用。 适用于 C++、Python、CMake 的编码规范和格式化流程。
询问 pixi 用法时使用。 适用于环境管理、依赖安装、任务运行、shell 交互、清理环境等。
询问为 SPONGE 安装、链接、修复或检查 skills 时使用。 适用于 AI 助手的本地或全局 skills 配置。
询问使用 SPONGE 的 PRIPS 对接机器学习/神经网络势场时使用。 适用于 Python plugin 编写、环境准备、力回填。
| name | sponge-toml-input |
| description | 询问 SPONGE 输入文件（mdin.spg.toml）的参数配置时使用。 适用于模拟参数设置、模块配置、输入输出文件指定等。 |
本技能适配 SPONGE 版本号：2.0.0-beta.1
SPONGE 的输入文件为 TOML 格式，默认文件名 mdin.spg.toml，通过 -mdin 参数指定：
SPONGE -mdin mdin.spg.toml
参数内容较多，按模块拆分为独立参考文件。本文件为索引，详细参数见各子文件。
| 文件 | 内容 |
|---|---|
| reference/core.md | 核心模拟参数：模式、步数、时间步长、截断距离等 |
| reference/io.md | 输入输出文件与输出控制参数 |
| reference/thermostat.md | 恒温器参数 |
| reference/barostat.md | 恒压器参数 |
| reference/constraint.md | 约束算法参数（SETTLE / SHAKE） |
| reference/neighbor_list.md | 邻居表参数 |
| reference/pme.md | PME 静电参数 |
| reference/enhanced_sampling.md | 增强采样参数（CV、MetaD、SITS） |
| reference/advanced.md | 高级参数：设备选择、墙约束、ReaxFF、插件等 |
md_name = "NVT water"
mode = "nvt"
step_limit = 50000
dt = 0.002
cutoff = 8.0
default_in_file_prefix = "WAT"
constrain_mode = "SHAKE"
thermostat = "middle_langevin"
thermostat_tau = 0.1
thermostat_seed = 2026
target_temperature = 300.0
write_information_interval = 1000
md_name = "NPT water"
mode = "npt"
step_limit = 100000
dt = 0.002
cutoff = 8.0
default_in_file_prefix = "WAT"
constrain_mode = "SHAKE"
thermostat = "middle_langevin"
thermostat_tau = 0.1
thermostat_seed = 2026
target_temperature = 300.0
barostat = "andersen_barostat"
barostat_tau = 0.1
barostat_update_interval = 10
target_pressure = 1.0
write_information_interval = 1000
md_name = "minimization"
mode = "minimization"
step_limit = 1000
default_in_file_prefix = "system"
cutoff = 8.0
write_information_interval = 100