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Deep exploration from a key paper using related, citing, reference, and citation tree tools. Triggers: 這篇論文的相關研究, 誰引用這篇, 類似文章, related articles, citation tree, paper exploration
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استنادا إلى تصنيف SOC المهني
Orchestrate pre-commit workflow including Memory Bank sync, README/CHANGELOG/ROADMAP updates, and MCP tool count sync. Triggers: GIT, gc, push, commit, 提交, 準備 commit, 要提交了, git commit, pre-commit, 推送.
Codex harness for PubMed Search MCP. Triggers: pubmed search, literature search, unified_search, pipeline, fulltext, release checklist, Codex.
Pipeline persistence — save, load, and reuse structured search plans. Triggers: pipeline, 管道, search plan, 搜尋計畫, 重複搜尋, saved search, 排程, schedule, workflow, DAG
Complete reference for all 46 PubMed Search MCP tools. Triggers: 工具列表, all tools, 完整功能, tool reference, 有哪些工具
Agent-guided PICO clinical question search using parse_pico handoff and unified_search. Triggers: PICO, 臨床問題, A比B好嗎, treatment comparison, clinical question, 療效比較
Auto-update CHANGELOG.md following Keep a Changelog format. Triggers: CL, changelog, 變更, 版本, version, 更新日誌, whatsnew.
| name | pubmed-paper-exploration |
| description | Deep exploration from a key paper using related, citing, reference, and citation tree tools. Triggers: 這篇論文的相關研究, 誰引用這篇, 類似文章, related articles, citation tree, paper exploration |
這個 workflow 用在「已經有一篇關鍵論文」之後的深挖。你可以沿三個方向展開：相似文獻、這篇引用了誰、誰又引用了它，再進一步建立 citation tree 或研究時間軸。
先用 unified_search 找到種子論文：
unified_search(
query="remimazolam randomized controlled trial",
limit=5,
ranking="quality"
)
拿到 PMID 後，再進入下面 workflow。
| 工具 | 作用 | 方向 |
|---|---|---|
fetch_article_details | 取得文章完整資訊 | 當前論文 |
find_related_articles | 找主題相近文章 | 橫向 |
get_article_references | 找這篇引用了誰 | 往過去 |
find_citing_articles | 找誰引用這篇 | 往未來 |
get_citation_metrics | 看引用影響力 | 評估重要性 |
build_citation_tree | 建立引用網路 | 視覺化 |
build_research_timeline | 建立時間軸 | 演化脈絡 |
fetch_article_details(pmids="30217674")
find_related_articles(pmid="30217674", limit=10)
get_article_references(pmid="30217674", limit=30)
find_citing_articles(pmid="30217674", limit=20)
get_citation_metrics(
pmids="30217674,35678901,34567890",
sort_by="relative_citation_ratio"
)
build_citation_tree(
pmid="30217674",
depth=2,
direction="both",
output_format="mermaid"
)
# Step 1: 當前論文
fetch_article_details(pmids="30217674")
# Step 2: 三個方向同時展開
find_related_articles(pmid="30217674", limit=10)
get_article_references(pmid="30217674", limit=20)
find_citing_articles(pmid="30217674", limit=20)
# Step 3: 對重要 PMIDs 做引用影響力排序
get_citation_metrics(
pmids="35678901,34567890,33456789",
sort_by="citation_count"
)
# Step 4: 視覺化引用網路
build_citation_tree(
pmid="30217674",
depth=2,
direction="both",
output_format="cytoscape"
)
build_research_timeline(
pmids="30217674,35678901,34567890",
topic="Remimazolam Clinical Development",
output_format="mermaid"
)
build_research_timeline(
topic="remimazolam",
max_events=20,
output_format="text"
)
get_fulltext(pmid="30217674", extended_sources=True)
get_article_figures(pmid="30217674")
優先看：
find_related_articles 與 find_citing_articles 都常出現的文章get_citation_metrics 中 RCR 或 citation count 高的文章build_citation_tree 網路中心位置的節點優先看：
find_citing_articles 的最近年份文章build_research_timeline 中最近幾個 milestone優先看：
get_article_references 回傳的早期高影響力論文fetch_article_details 不等於引用網路工具；引用與被引用應分別使用 get_article_references 和 find_citing_articlesbuild_citation_tree 一次只接受一個 PMID，不要一次傳多篇unified_search 找，不要直接猜