OpenCode_Ecosystem

Skill do ecossistema OpenCode - nexus

Skill de análise fenomenológica: entrevistas em profundidade, epoché, redução fenomenológica e análise temática de experiências vividas.

Skill de análise construtivista: ciclo de aprendizagem (assimilação-acomodação), design construtivista para MAS, protocol enforcement e evolução em runtime.

Skill de coleta e gestão de dados qualitativos: entrevistas, grupos focais, observação, narrativas, diários, COREQ checklist, triangulação, protocolos de coleta.

Skill de Estudo de Caso: design de caso único/múltiplo, triangulação de fontes, protocolo de coleta e análise contextual.

Skill de análise do paradigma fenomenológico: intencionalidade (Husserl), corporeidade (Merleau-Ponty), ser-no-mundo (Heidegger), IA enativa, cognição 4E, robótica social fenomenológica.

Skill de Grounded Theory: coding aberto/axial/seletivo, memorandos teóricos, amostragem teórica e construção indutiva de teoria.

Skill de meta-análise: síntese quantitativa de efeitos, forest plot, heterogeneidade (I²), viés de publicação (funnel plot), meta-regressão, subgrupos, PRISMA.

Skill de Pesquisa-Ação: ciclo planejamento-ação-reflexão, design participativo, intervenção transformadora e avaliação colaborativa.

Skill de análise pós-estruturalista: análise foucaultiana de discurso, desconstrução derridiana, análise de poder-saber em IA, governança algorítmica e Diamond Model.

Skill de análise em Psicologia Clínica: avaliação psicológica multiagente, psicodiagnóstico DSM-5/ICD-11, integração com métodos qualitativos e paradigmas fenomenológico/construtivista.

Skill do paradigma Interpretativista: compreensão de significados subjetivos, análise hermenêutica, métodos qualitativos e estudo de caso.

Skill do paradigma Positivista: método hipotético-dedutivo, falseabilidade, experimentos controlados, generalização estatística e replicabilidade.

Skill para Análise Qualitativa de dados textuais usando Análise Temática (Braun & Clarke) e Grounded Theory. Suporta codificação aberta, axial e seletiva com geração de categorias emergentes.

Skill para design e execução de Métodos Mistos: sequencial (QUAN→qual ou qual→QUAN) e convergente paralelo, integrando análises quantitativas e qualitativas com triangulação.

Skill para integrar o domínio das Neurociências como conhecimento cruzado no ecossistema. Abrange neurociência cognitiva, computacional e clínica com referências a fMRI, EEG e neuroimagem.

Skill para conduzir Revisão Sistemática da Literatura seguindo protocolo PRISMA 2020. Inclui formulação PICOS, busca estruturada, triagem, extração e síntese narrativa.

OpenCode Reasoning Orchestrator v9.0 — 68 tipos de raciocínio (58 base + 10 Teoria dos Jogos). Integrado com AuditSystem, TokenEconomy e DataOrchestrator. Use para selecionar framework lógico, nível de profundidade e matriz de interseção com validação de diversidade de raciocínio.

Skill do ecossistema OpenCode - criador-artigo

Servidor MCP para acesso a literatura acadêmica via Sci-Hub. Permite buscar, baixar e extrair metadados de artigos científicos através de DOI, PMID ou URL. Use para: pesquisa acadêmica, revisão de literatura e validação científica.

Auditoria Academica Caixa Branca com rastreamento minucioso. Registra todas as interacoes com o ecossistema OpenCode, fornecendo rastreabilidade de cada afirmacao, evidencia e decisao. Compativel com protocolo TSAC (87 palavras banidas), padroes Qualis A1 e paradigmas epistemologicos multiplos.

Skill do ecossistema OpenCode - book-export-latex

Automation Governance skill for the OpenCode ecosystem

Blockchain Auditor skill for the OpenCode ecosystem

Compliance Auditor skill for the OpenCode ecosystem

Data Consolidation skill for the OpenCode ecosystem

Document Generator skill for the OpenCode ecosystem

Mcp Builder skill for the OpenCode ecosystem

Orchestrator skill for the OpenCode ecosystem

Workflow Architect skill for the OpenCode ecosystem

Retrieve and analyze AlphaFold predicted structures for a protein. Use when the user provides a specific UniProt Accession ID and wants structural confidence metrics (pLDDT), domain boundary analysis, or disorder assessment. Do not use if the user only has a protein name, gene name, or amino acid sequence — ask for a UniProt ID first.

Analyzes genetic variant effects on gene expression (RNA-seq), chromatin accessibility (DNASE), histone marks (ChIP), and transcription factors using the AlphaGenome API. Use when the user asks about non-coding variant effects, pathogenicity, clinical significance, disease associations, functional effects, gene expression changes, splicing disruption, or regulatory effects in promoters and enhancers. Also use for resolving biological terms to tissue/cell-type ontologies (UBERON/CL) or analyzing variants in chr:pos:ref>alt format.

Query the ChEMBL database for bioactive molecules, drug targets, bioactivity data, approved drugs, and chemical structures. Use when the user asks about compounds, targets, IC50/Ki values, drug mechanisms, or structure searches.

Use when needing clinical significance, pathogenicity classifications (e.g., Pathogenic, Benign, VUS), clinical evidence rationales, or finding "hard positive" benchmark controls for human genomic variants.

Query and search the EMBL-EBI Ontology Lookup Service (OLS) for biomedical ontology terms, definitions, and hierarchies across 250+ ontologies (e.g., GO, DOID, HP). Use when the user asks to search for terms, retrieve details, navigate hierarchies (parents, children, ancestors), look up properties and individuals, get autocomplete suggestions, or access ontology metadata and statistics.

Query the ENCODE Registry of cis-Regulatory Elements (cCREs) via the SCREEN GraphQL API, or make custom queries to the ENCODE Portal REST API for experiments and files (ChIP-seq peaks, etc.). Use when you want to query regulatory annotations or raw experimental data across human cell types.

Performs 3D structural searches of proteins against various databases (PDB, AlphaFold, CATH, MGnify, etc.) using the Foldseek API. Use ONLY when the user provides a physical 3D coordinate file (.cif, .mmcif, or .pdb) and wants to find structurally similar proteins. Do NOT use if the user only provides a protein sequence, gene name, or UniProt ID.

Use when you want to retrieve semi-quantitative protein expression and spatial localisation data from the Human Protein Atlas (HPA).

Query the JASPAR database for Transcription Factor (TF) binding profiles. Use when retrieving Position Frequency Matrices (PFMs) or Position Weight Matrices (PWMs) for specific TFs, resolving gene symbols to JASPAR Matrix IDs, or getting TF metadata. Supports multiple output formats (MEME, TRANSFAC, PFM, JASPAR, YAML).

Query the OpenAlex scholarly database for research papers, authors, institutions, topics, sources, publishers, funders, geo-locations, and keywords. Use when searching academic papers, resolving DOIs, downloading open-access PDFs, finding an author's publications, aggregating bibliometric data (citation counts, h-index, impact factor), exploring the research taxonomies, or performing DOI lookups.