バックグラウンドジョブの実行・管理を扱うスキルです。 mtl-bg-job, background job, バックグラウンドジョブ, 長時間計算, チェックポイント, checkpoint, キュー管理, queue, Notebook分離実行, ブラウザ閉じても計算継続 に関するコード生成時に使用してください。
分子動力学(MD)シミュレーションを扱うスキルです。 Langevin, VelocityVerlet, NVTBerendsen, NPTBerendsen, NVE, NVT, NPT, MaxwellBoltzmannDistribution, thermalize_momenta, exact_temperature, MDLogger, timestep, friction, temperature_K, MDFeature, MDFeatureResult, ASEMDSystem, LangevinIntegrator, NPTIntegrator, チェックポイント, checkpoint, PostMDDiffusionFeature, PostMDSpecificHeatFeature, PostEMDViscosityFeature, PostNEMDViscosityFeature, PostNEMDThermalConductivityFeature, PLUMED, メタダイナミクス, metadynamics, FES, collective variable, 熱分解, pyrolysis, get_mol_list, フラグメント解析, fragment analysis, DepositionScheduler, ApplyUniformEfield, ElasticVirtualWall, Matlantis-LAMMPS, LAMMPS, OpenMM, pair_style pfp_api, 分子動力学, MD, 拡散係数, 粘度, 熱伝導率 に関するコード生成時に使用してください。
外部データベースからの構造取得とファイル形式変換を扱うスキルです。 PubChem, Materials Project, mp-api, AFLOW, COD, Gaussian, VASP, 外部データ, external data, データベース, database, CID, SMILES, SDF, CIF, POSCAR, API key, pubchem_atoms_search, 構造取得, 構造インポート, DFT入力生成 に関するコード生成時に使用してください。
統合ワークフロー（パイプライン）テンプレートを扱うスキルです。 構造スクリーニング, structure screening, 吸着構造探索, adsorption structure search, 欠陥解析, defect analysis pipeline, バッチ処理, batch processing, パイプライン, pipeline, ワークフロー, workflow, エネルギーランキング, energy ranking, 早期棄却フィルタ, early rejection filter, 2段階緩和, two-stage relaxation に関するコード生成時に使用してください。
Guide for writing Python code using Matlantis, Matlantis Corp.'s cloud-based atomistic simulation platform powered by neural network potentials (PFP). Use this skill whenever the user asks about Matlantis, PFP (Preferred Potential), matlantis-features, pfp-api-client, MTCSP, or any atomistic/molecular simulation on the Matlantis platform. Also trigger when code involves imports like pfp_api_client, matlantis_features, or mtcsp_api_client.
構造モデリングを扱うスキルです。表面(slab)切り出し、分子生成、原子置換、複雑系構造の構築を包括します。 generate_all_slabs, pymatgen, get_orthogonal_c_slab, miller_index, fcc111, slab, SMILES, RDKit, Chem.MolFromSmiles, EmbedMolecule, 分子生成, 原子置換, ドーピング, substitute, LiquidGenerator, EMC, ポリマー, 液体, アモルファス, HEA, 高エントロピー合金, PartialOccupancy, wrap_molecule, get_mol_list, CollisionDetector, 衝突検出, FixAtoms, 拘束条件, 表面モデル, 真空層 に関するコード生成時に使用してください。
構造最適化（構造緩和）を扱うスキルです。 LBFGS, LBFGSLineSearch, BFGS, BFGSLineSearch, QuasiNewton, FIRE, FIRE2, ABC-FIRE, GoodOldQuasiNewton, CellAwareBFGS, RFO, GPMin, MDMin, PreconLBFGS, PreconFIRE, SciPyFminBFGS, SciPyFminCG, BasinHopping, MinimaHopping, fmax, 構造最適化, 構造緩和, geometry optimization, FrechetCellFilter, ExpCellFilter, UnitCellASEFilter, セル最適化, cell optimization, FixSymmetry, 対称性保持, maxstep, ASEOptFeature, BFGSASEOptFeature, BFGSLineSearchASEOptFeature, LBFGSASEOptFeature, LBFGSLineSearchASEOptFeature, FireASEOptFeature, FireLBFGSASEOptFeature, MDMinASEOptFeature, filter=True, 多段階最適化, 収束基準, trajectory, preconditioned optimizer, グローバル最適化, global optimization に関するコード生成時に使用してください。
pfcc_extras (Matlantis/ASE workflow utilities) を使うコード生成時に使用します。 可視化 (show_gui, view_ngl, SurfaceEditor)、構造加工 (smiles_to_atoms, LiquidGenerator, make_alloy, makesurface, 各種 interface)、MD スケジューラー (DepositionScheduler, ApplyUniformEfield など)、物性解析 (MonteCarlo, GCMC, calculate_bulk_modulus, 粘度・熱伝導率, trajectory 変換)、吸着・構造探索 (adsorption_structure_search)、ジョブ実行制御 (run_jobs, ResourceAwareJobScheduler, parameter sweep) を扱います。