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对某个理论、方法或主题分类下的 Zotero 精读 notes 生成分类脉络综述；默认使用 Obsidian 双链交叉引用，方便从综述跳转到单篇论文笔记。

基于新版精读 notes 生成理论、方法、主题候选分类与人工审核队列；也可生成 Zotero 写回 dry-run 计划，但第一版不真实写回 Zotero。

根据新版精读笔记回答问题。只使用 notes\\zotero_reading 下的有效笔记，不扫描旧 note，不回到 Zotero 原库重新阅读。

单次问答技能。根据新版精读笔记定位证据并回答用户问题。

检查 Zotero 索引、精读 notes、分类属性、Publication Tag 与 Obsidian Bases 视图之间的同步状态；生成健康报告、属性补齐 dry-run、期刊等级同步和位置整理。

收到“更新索引”或“请精读 Zotero 中 xxx”时使用。先刷新本地索引，再由 Python 精读流水线优先读取 Zotero 的全文缓存（.zotero-ft-cache），必要时才回退 PDF，并结合外部 embedding / LLM 生成结构化精读笔记。

收到“更新索引”时使用。查询 Zotero，生成支持 AI 精读流水线的本地索引，重点强化分组、PDF 路径、附件 key 和全文缓存路径。

将 PDF 原文阅读结果写成新版本精读笔记，只写入 notes\\zotero_reading，并同步操作日志与断点状态。