文献调研引导工作流，覆盖检索、筛选、综合与输出四个步骤。 适用于开题调研、方法对比、争议梳理和综述提纲生成；在线时优先调用 search_literature， 离线时自动切换到手动模式，引导用户上传 PDF 或提供引用列表。
文献调研引导工作流，覆盖检索、筛选、综合与输出四个步骤。 适用于开题调研、方法对比、争议梳理和综述提纲生成；在线时优先调用 search_literature， 离线时自动切换到手动模式，引导用户上传 PDF 或提供引用列表。
npx skills add https://github.com/lewisoepwqi/scientific_nini --skill literature-reviewこのコマンドをClaude Codeにコピー＆ペーストしてスキルをインストール
生成符合 Nature/Science/Cell 等顶级期刊投稿标准的科研图表。自动输出 matplotlib/seaborn 可执行代码、PDF/PNG/EPS 矢量图、标准图注（Figure Legend）及提交前自检清单。支持柱状图、折线图、散点图、热图、Kaplan-Meier 生存曲线、火山图、多面板组合图。触发词：论文图、发表级图表、期刊图表、Nature图、Science图、Cell图、投稿用图、科研绘图、论文插图、高分辨率图表、矢量格式图表。
根据会话中已完成的数据分析结果，逐章生成结构完整的科研论文初稿（含摘要、引言、方法、结果、讨论、结论），并将各章节保存为工作区文件
实验设计引导工作流，覆盖问题定义、设计选择、样本量计算、方案生成四个步骤。 当用户提到：实验设计、样本量估算、研究方案、RCT、随机对照试验、功效分析、 效应量、检验功效、实验方案、研究设计时使用。适用于临床研究、基础科研和量化研究设计阶段。
论文写作引导工作流，负责将当前会话中的分析结果桥接为可写作的素材包、 章节结构与分节撰写提示。适用于论文初稿、实验报告和结果章节整理。
基于用户上传文献 PDF 或参考图表，先提炼分析方法与作图思路，再对上传数据执行复现分析并输出图表与报告
植物根长度数据的自动化统计分析，包含方差分析(ANOVA)、Tukey HSD多重比较和出版级可视化。 当用户提到：根长度、植物表型、处理组比较（Mock vs ISX）、R语言ANOVA分析，或提供包含 sample/treatment/length列的CSV/Excel数据时使用。也适用于生物统计和科学绘图。
| name | literature-review |
| description | 文献调研引导工作流，覆盖检索、筛选、综合与输出四个步骤。 适用于开题调研、方法对比、争议梳理和综述提纲生成；在线时优先调用 search_literature， 离线时自动切换到手动模式，引导用户上传 PDF 或提供引用列表。 |
| category | workflow |
| research-domain | general |
| difficulty-level | advanced |
| typical-use-cases | ["围绕研究主题快速收集候选文献","对近年核心论文进行人工筛选与证据综合","生成带来源标注的综述草稿提纲"] |
| allowed-tools | ["search_literature","workspace_session","task_state","analysis_memory"] |
| user-invocable | true |
| disable-model-invocation | false |
| contract | {"version":"1","trust_ceiling":"t1","evidence_required":true,"steps":[{"id":"search_papers","name":"文献检索","description":"优先调用 search_literature 检索候选文献；离线时切换到手动模式","tool_hint":"search_literature","depends_on":[],"trust_level":"t1","review_gate":false,"retry_policy":"skip"},{"id":"filter_papers","name":"文献筛选","description":"按研究问题、时效性、证据层级和相关性筛选候选文献","tool_hint":null,"depends_on":["search_papers"],"trust_level":"t1","review_gate":false,"retry_policy":"skip"},{"id":"synthesize","name":"证据综合","description":"提炼共同结论、争议点、研究空白，并为每个结论保留来源映射","tool_hint":null,"depends_on":["filter_papers"],"trust_level":"t1","review_gate":false,"retry_policy":"skip"},{"id":"generate_output","name":"输出生成","description":"生成带 O2 草稿级声明的综述摘要或提纲，缺证据处显式标注待验证","tool_hint":null,"depends_on":["synthesize"],"trust_level":"t1","review_gate":false,"retry_policy":"skip"}],"input_schema":{"type":"object","properties":{"topic":{"type":"string","description":"研究主题或检索问题"},"year_from":{"type":"integer","description":"可选的起始年份"}}},"output_schema":{"type":"object","properties":{"review_outline":{"type":"string","description":"带来源标注的综述草稿"},"evidence_table":{"type":"array","description":"结论与来源映射表"}}}} |
输出等级声明：本 Skill 全部输出均为 O2 草稿级，仅用于研究准备与写作辅助，引用前必须人工复核。 证据约束：每个关键结论都必须标注来源；没有来源支撑的断言必须标注为“缺少文献支撑，需进一步检索验证”。
本技能采用四步线性流程：检索 → 筛选 → 综合 → 输出。默认先尝试在线检索；若网络不可用，则立即转入手动模式，不静默失败。
search_literature，参数建议包含：
query：主题词、疾病名、方法名、关键机制year_from：需要聚焦近年研究时设置sort_by：默认 relevance；若做近年进展综述可改为 date当 search_literature 返回离线或降级提示时，必须明确告知用户：
当前为离线模式，无法在线检索文献。请上传 PDF、粘贴参考文献列表，或提供 DOI/标题后继续。
随后引导用户选择一种手动输入方式：
不得假装已经完成在线检索；必须明确区分“在线结果”和“用户手动提供的文献”。
围绕研究问题建立筛选清单，对每篇候选文献至少判断以下维度：
筛选输出建议使用三栏结构：
综合阶段必须以“结论 - 证据 - 争议/局限”三联结构组织内容。推荐模板：
结论：
证据：
- [作者, 年份, 标题]
争议/局限：
必须覆盖以下内容：
若某个判断仅来自单篇文献，必须显式标注“单一来源，需扩大检索后再确认”。
输出可以是综述摘要、章节提纲或证据表，但必须包含以下部分：
(作者, 年份, 标题) 形式的来源标注## 文献调研摘要（O2 草稿级）
### 1. 核心发现
- 结论 A（作者1，2023，标题1；作者2，2024，标题2）
- 结论 B（缺少文献支撑，需进一步检索验证）
### 2. 争议点
- 争议 A：...
### 3. 研究空白
- 空白 A：...
### 4. 建议下一步
- 补充关键词：
- 优先阅读全文：