research-lab

name	research-lab
description	科研模式入口。当用户说"进入科研模式"、"开始做科研"、发论文链接、 提到研究课题/假设/实验/文献综述时激活。提供假设驱动循环、 PubMed文献检索、证据追踪、研究项目管理等科研能力。

🔬 Research Lab — 科研模式

触发词

"进入科研模式"、"开始做科研"、"research mode"、发论文链接(arxiv/doi)、 提到"假设"、"实验设计"、"文献综述"、"研究课题"

能力清单

1. 文献检索与阅读

• PubMed 搜索: bash skills/research-lab/scripts/pubmed-search.mjs "关键词" [--max 10]
• 论文阅读: 微信/网页论文自动提取+摘要+关键点提炼
• 文献管理: 录入飞书追踪表

2. 假设驱动循环（Hypothesis-Driven Loop）

Plan → Evidence → Review → Iterate

• 假设提出: 结构化记录到 research/projects/{name}/hypotheses.md
• 证据收集: 自动/手动收集支持/反驳证据
• 评估审查: 定期回顾假设状态
• 迭代: 根据证据调整假设

3. 研究项目管理

• 项目目录: research/projects/{project-name}/
• 每个项目包含:
  • README.md — 项目概述
  • hypotheses.md — 假设追踪
  • evidence/ — 证据文件
  • notes/ — 阅读笔记
  • references.md — 参考文献列表
  • progress.md — 进展日志

4. 知识整合

• 飞书文档: 研究笔记/论文草稿
• 飞书表格: 假设追踪表/文献管理表
• Memory: 长期研究记忆（自动更新 MEMORY.md）

使用方式

进入科研模式

用户说"进入科研模式"时:

1. 确认当前研究项目（已有则加载，没有则创建）
2. 展示项目状态（假设数、文献数、最近进展）
3. 列出可用操作

日常操作

• "搜一下 XXX 的最新论文" → PubMed 搜索
• "读一下这篇论文 [链接]" → 提取+摘要+录入
• "提出一个假设：XXX" → 结构化记录
• "整理一下目前的证据" → 汇总分析
• "项目进展怎么样" → 状态报告

退出科研模式

"退出科研模式"或"回到正常模式" → 保存状态，恢复正常

工具依赖

• PubMed E-utilities API（免费，无需key）
• arXiv API（免费，无需key，支持短语匹配）
• Semantic Scholar API（免费，无需key，含引用统计/TLDR）
• 微信文章读取（已有 wechat-article-reader）
• 飞书文档/表格 API（已有）

搜索脚本速查

Node.js 脚本（代理支持好，推荐日常用）

脚本	覆盖领域	用法
arxiv-search.mjs	CS/AI/ML/数学/物理	node arxiv-search.mjs "关键词" --max 10 --sort date
pubmed-search.mjs	生物医学/生命科学	node pubmed-search.mjs "关键词" --max 10 --sort date
s2-search.mjs	综合学术（含引用数）	node s2-search.mjs "关键词" --max 10 --sort citationCount
scholar-search.mjs	三源合一	node scholar-search.mjs "关键词" --sources all --max 5

Python 工具（paperscraper + semanticscholar）

命令	说明
python3.11 scholar.py search "关键词" --source all --max 5	统一搜索
python3.11 scholar.py search "关键词" --source s2 --json	仅 Semantic Scholar（含引用/TLDR）
python3.11 scholar.py search "关键词" --source pubmed	仅 PubMed
python3.11 scholar.py download DOI_OR_ARXIV_ID -o ./papers/	下载 PDF

通用参数: --max N 数量 | --sort date|relevance|citationCount | --json JSON输出 scholar-search.mjs 额外参数: --sources all|arxiv|pubmed|s2

已安装 Python 包

• paperscraper 0.3.6 — PubMed/arXiv/bioRxiv/medRxiv/chemRxiv 搜索 + PDF 下载
• semanticscholar 0.12.0 — Semantic Scholar API 客户端（引用图谱/推荐）