pubmed-linker

name	pubmed-linker
description	PubMed 文献链接查询与更新技能。系统化查询参考文献的 PubMed 链接、PMID、DOI，批量更新 Reference_list.md，检测开放获取状态并下载全文。需配合 MCP PubMed 工具。

PubMed Linker - 文献链接查询与更新

Overview

系统化使用 MCP PubMed 工具查询文献信息并更新参考文献列表的链接，支持批量处理和全文下载检测。

Available MCP Tools

• pubmed_search / pubmed_quick_search — 搜索文献
• pubmed_get_details / pubmed_batch_query — 获取详细信息
• pubmed_extract_key_info — 提取关键摘要
• pubmed_download_fulltext / pubmed_batch_download — 下载全文 PDF
• pubmed_detect_fulltext — 检测开放获取状态
• pubmed_cross_reference — 查找相关文献

Workflow

1. 解析引用

从 Reference_list.md 提取：第一作者姓氏、题目关键词(2-3个)、期刊名、发表年份。

2. 优先级搜索策略

策略 1：作者姓氏 AND 关键词1 AND 关键词2 策略 2：期刊名[ta] AND 年份[dp] AND 关键词 策略 3：完整题目精确匹配

3. 验证匹配

匹配成功需满足：PMID 存在、作者匹配、题目相似度 >80%、年份一致、期刊匹配。

4. 更新文档

在原始引用后添加：

- **PMID**: {PMID}
- **PubMed**: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/{PMID}/
- **DOI**: https://doi.org/{DOI}
- **Fulltext**: {下载链接或状态}

5. 批量处理

• 每次处理 5-10 篇，避免超时。
• 优先使用 pubmed_batch_query。
• 维护处理进度，支持断点续传。

Error Handling

• 未找到 → 尝试不同策略 → 标注 ⚠️ 未找到匹配
• 多个匹配 → 选最佳 → 若有歧义标注 ⚠️ 需人工确认
• 全文不可获取 → 检测开放获取 → 标注 🔒 订阅限制

Guardrails

• 精确性优先：多条件交叉验证。
• 保留原始引用格式不修改。
• 对无法确认的信息明确标注。
• PubMed 数据库有延迟，最新文献可能未收录。
• 非 PubMed 收录文献需手动处理。

关联 Skill（网络调度协议）

关系	Skill	场景
被调用	paper-reader	精读后查找引用链接
被调用	deep-research	批量查找 PubMed 链接