onescience-installer

name	onescience-installer
description	OneScience 环境安装技能。用于根据 onescience.json 安装或验证 OneScience、创建或复用 conda 环境、检测已有 onescience 包、在记录的 conda 环境或当前环境中安装 Python 包；缺少 run_site 或远程 SSH 配置时先调用 onescience-runsite 补齐运行站点配置。
type	executor

OneScience 安装器

主流程

1. 读取根目录 onescience.json。
2. 校验运行站点配置：
   • 必须能从 onescience.json.runtime.execution_profile.run_site 获取 local 或 remote。
   • 当 run_site=remote 时，必须能从 onescience.json.runtime.ssh 获取 SSH 信息。
   • 如果缺少 run_site，或 run_site=remote 但 SSH 信息不完整，读取 ./references/runsite-handoff.md，调用 skills/onescience-runsite 补齐配置；只有 runsite 成功写回或更新 onescience.json 后，才能继续安装流程。
3. 读取 ./references/discover-route.md，识别用户意图、安装领域、Python 包列表、runtime.conda 状态和目标环境路径。
4. 根据“意图 + 环境路径 + conda 状态”读取对应分支文件，并且只读取命中的分支文件。
5. 需要渲染探测、安装、验证命令时，读取 ./references/install_flow.md。
6. OneScience 自身是特殊 bootstrap 目标，不属于普通 Python 包：安装 onescience、OneScience 环境、earth/cfd/bio/matchem/all 时必须下载/同步 workspace_bootstrap_profiles.json 指定的仓库到 {repo_dir}，进入仓库后执行 bash install.sh {dependency_selector}；不得渲染 pip install onescience、python -m pip install onescience 或把 onescience 放入 {python_packages}。
7. 检测成功、安装成功且验证成功后，读取 ./references/writeback-conda-state.md 写回 onescience.json.runtime.conda。
8. 写回成功后，若当前任务带有上游 handoff / resume 信息，则返回调用它的技能继续执行；若没有明确调用方，则交回 onescience-orchestrator 规划后续任务。

必要资产

• ./assets/backend_profiles.json：环境名、Python 版本、module 顺序、verify 口径。
• ./assets/workspace_bootstrap_profiles.json：OneScience 仓库和 install.sh 入口。
• ./assets/install_domains.json：earth/cfd/bio/matchem/all 到 install selector 的映射。
• ./assets/conda_env.example.json：成功写回格式示例。

installer 的环境信息写回位置是 onescience.json.runtime.conda。除 runtime.conda 外，不修改 onescience.json 的其它信息。

意图识别流程

1. 用户要求“安装 OneScience 环境”“安装 earth/cfd/bio/matchem/all 环境”“安装 onescience 包”“初始化 OneScience 环境”时，设为 install_intent=bootstrap。onescience 包名大小写不敏感，命中后永远按 bootstrap 处理。
2. 用户要求“安装 Python 包”“安装 pip 包”“补装依赖”“安装某个包到 OneScience 环境”时，设为 install_intent=python_packages；但包名列表里若包含 onescience，必须拆分并将 onescience 路由到 install_intent=bootstrap，其余普通 Python 包才允许继续走 pip 分支。
3. 用户没有明确意图时，先询问要安装 OneScience 环境还是安装 Python 包；不要在意图未知时进入安装分支。
4. install_intent=bootstrap 必须解析安装领域；无法从请求映射到 install_domains.json 时，询问用户安装哪个领域或是否安装 all。
5. install_intent=python_packages 必须解析包名列表；缺少包名时只询问包名。

分支映射

前置状态 / 用户意图	必读工作流
缺少 run_site，或远程模式缺少 SSH 信息	./references/runsite-handoff.md
进入安装后的通用发现、意图识别、路径判定	./references/discover-route.md
runtime.conda 缺失，需要先判断目标环境是否已有 OneScience 包	./references/detect-existing-onescience.md
意图是安装 OneScience，且目标路径是创建或复用 Conda 环境	./references/install-onescience-conda.md
意图是安装 OneScience，且目标路径是当前环境	./references/install-onescience-current.md
意图是安装 Python 包，且目标路径是 Conda 环境	./references/install-python-packages-conda.md
意图是安装 Python 包，且目标路径是当前环境	./references/install-python-packages-current.md
检测成功、安装成功并验证成功后需要写回 onescience.json.runtime.conda	./references/writeback-conda-state.md

硬门禁

• 环境检测阶段（detect-existing-onescience.md）：可直接执行检测命令，不需要用户确认；检测完成后只报告结果，不得自动创建环境或安装包。
• 创建 Conda 环境、安装 OneScience、安装 Python 包前：必须获得用户明确同意。
• run_site=remote 时，在 SSH 信息齐备前不要执行安装、验证或包检测。
• run_site=remote 时不要在本端 shell 执行 conda、git clone、install.sh 或 pip install。
• 禁止用 pip 安装 OneScience 自身：任何 pip install onescience、python -m pip install onescience、pip install {python_packages} 且 {python_packages} 含 onescience 的命令都必须视为错误路由并停止，改走 install-onescience-conda.md 或 install-onescience-current.md。
• runtime.conda 缺失时，必须先走 detect-existing-onescience.md；若目标环境已有 onescience 和 torch 包，写回环境信息到 runtime.conda 并返回，不创建环境；若都没有，只报告检测结果，询问是否创建 conda 环境并安装 onescience。
• 已有 runtime.conda.enabled=true 时，后续 Conda 路径必须使用记录的 env_name 和 activate_script。
• 已有 runtime.conda.enabled=false 时，默认按当前环境路径处理；除非用户明确同意，否则不要创建 Conda 环境。
• 安装失败或验证失败时，不要写入成功状态。

输出契约

阶段汇报和最终输出至少包含：

• run_site
• workflow
• install_intent
• install_state
• verify_state
• conda_writeback
• next_action
• resume_target
• resume_phase