基于用户上传文献 PDF 或参考图表，先提炼分析方法与作图思路，再对上传数据执行复现分析并输出图表与报告
基于用户上传文献 PDF 或参考图表，先提炼分析方法与作图思路，再对上传数据执行复现分析并输出图表与报告
npx skills add https://github.com/lewisoepwqi/scientific_nini --skill literature-chart-driven-analysisCopy and paste this command into Claude Code to install the skill
生成符合 Nature/Science/Cell 等顶级期刊投稿标准的科研图表。自动输出 matplotlib/seaborn 可执行代码、PDF/PNG/EPS 矢量图、标准图注（Figure Legend）及提交前自检清单。支持柱状图、折线图、散点图、热图、Kaplan-Meier 生存曲线、火山图、多面板组合图。触发词：论文图、发表级图表、期刊图表、Nature图、Science图、Cell图、投稿用图、科研绘图、论文插图、高分辨率图表、矢量格式图表。
根据会话中已完成的数据分析结果，逐章生成结构完整的科研论文初稿（含摘要、引言、方法、结果、讨论、结论），并将各章节保存为工作区文件
实验设计引导工作流，覆盖问题定义、设计选择、样本量计算、方案生成四个步骤。 当用户提到：实验设计、样本量估算、研究方案、RCT、随机对照试验、功效分析、 效应量、检验功效、实验方案、研究设计时使用。适用于临床研究、基础科研和量化研究设计阶段。
文献调研引导工作流，覆盖检索、筛选、综合与输出四个步骤。 适用于开题调研、方法对比、争议梳理和综述提纲生成；在线时优先调用 search_literature， 离线时自动切换到手动模式，引导用户上传 PDF 或提供引用列表。
论文写作引导工作流，负责将当前会话中的分析结果桥接为可写作的素材包、 章节结构与分节撰写提示。适用于论文初稿、实验报告和结果章节整理。
植物根长度数据的自动化统计分析，包含方差分析(ANOVA)、Tukey HSD多重比较和出版级可视化。 当用户提到：根长度、植物表型、处理组比较（Mock vs ISX）、R语言ANOVA分析，或提供包含 sample/treatment/length列的CSV/Excel数据时使用。也适用于生物统计和科学绘图。
| name | literature_chart_driven_analysis |
| description | 基于用户上传文献 PDF 或参考图表，先提炼分析方法与作图思路，再对上传数据执行复现分析并输出图表与报告 |
| category | workflow |
| allowed-tools | ["ask_user_question","dataset_catalog","workspace_session","clean_data","evaluate_data_quality","stat_test","stat_model","stat_interpret","code_session","chart_session","export_chart","report_session","export_report"] |
当用户上传了 PDF 文献 或 参考图表图片，并希望“按文献方法/图表风格分析自己的数据”时，智能体必须按本技能执行，产出可复现的分析结果、图表与报告。
出现以下任一意图时触发：
输出结构化“方法摘要”：
输出结构化“作图摘要”：
约束：若无法可靠提取某些细节，必须明确“已识别信息”与“待用户确认信息”。
将文献方法与图表风格融合，形成计划并展示给用户确认：
基于用户上传数据执行：
报告至少包含：
dataset_catalog / workspace_sessionevaluate_data_quality / clean_datastat_test、stat_model、stat_interpret 等image_analysiscode_sessionchart_session / export_chartreport_session / export_report## 一、参考资料解读
### 1) 文献方法摘要
- ...
### 2) 参考图表摘要
- ...
## 二、对用户数据的执行方案
- 数据预处理：...
- 统计方法：...
- 作图策略：...
## 三、分析结果
- 核心发现 1：...
- 核心发现 2：...
## 四、图表与说明
- 图 1（主图）：...
- 图 2（补充图，可选）：...
## 五、结论与后续建议
- 结论：...
- 局限：...
- 建议：...