القائمة
Use when counting amino-acid letters in raw protein sequence lines inside simple EDirect text pipelines.
يُحدَّد Prompt الذي يراجع المصدر أولًا بشكل افتراضي. يمكنك التبديل إلى أمر مباشر أو تنزيل نسخة محلية.
اقرأ SKILL.md وأي ملفات مرافقة يعرضها SkillsMP قبل أن تقرر التثبيت.
التثبيت باستخدام Codex أو Claude انسخ هذا Prompt والصقه في Codex أو Claude أو مساعد آخر ليراجع صفحة Skill ويثبّتها لك.
يتجاوز الأمر المباشر Prompt المخصّص للمراجعة. افحص المصدر قبل تشغيله.
npx skills add https://github.com/vimalinx/bio-agent --skill amino-acid-compositionيبقى الأمر في سطر واحد. مرّر أفقيًا لمراجعته كاملًا قبل النسخ.
تفضّل نسخة محلية؟ نزّل الملفات المتاحة حاليًا لدى SkillsMP.
استنادا إلى تصنيف SOC المهني
عرض SKILL.md
| name | amino-acid-composition |
| description | Use when counting amino-acid letters in raw protein sequence lines inside simple EDirect text pipelines. |
| disable-model-invocation | true |
| user-invocable | true |
CLI tool from the Entrez Direct (EDirect) package for computing amino acid composition of protein sequences.
printf 'ACDE\n' | PATH=/home/vimalinx/miniforge3/envs/bio/bin:$PATH /home/vimalinx/miniforge3/envs/bio/bin/amino-acid-composition/home/vimalinx/miniforge3/envs/bio/bin/amino-acid-composition# 1) Count amino acids in a single raw sequence line
printf 'ACDE\n' | \
PATH=/home/vimalinx/miniforge3/envs/bio/bin: \
/home/vimalinx/miniforge3/envs/bio/bin/amino-acid-composition
# 2) Strip FASTA headers first if your input came from a FASTA file
grep -v '^>' proteins.fa | \
PATH=/home/vimalinx/miniforge3/envs/bio/bin:$PATH \
/home/vimalinx/miniforge3/envs/bio/bin/amino-acid-composition
>p1 will be treated as sequence text and counted.sort-uniq-count, so keep the bio / EDirect bin directory on PATH.Ala, Asx, Xle, Pyl, Sec, Xxx, Glx, etc.), not just the canonical 20 amino acids.