cellranger-processor

Cell Ranger skill for 10X Genomics single-cell data processing

Repository: a5c-ai/babysitter
Letzte Quellaktivität: 1. Juni 2026 um 07:46
Erkannte Sprache von SKILL.md: Englisch
Sterne: 1.652
Forks: 96

Installationsoptionen

Standardmäßig ist der Prompt ausgewählt, der zuerst die Quelle prüft. Sie können zu einem direkten Befehl wechseln oder eine lokale Kopie herunterladen.

Mit Codex oder Claude installieren Kopieren Sie diesen Prompt, fügen Sie ihn in Codex, Claude oder einen anderen Assistant ein und lassen Sie die Skill-Seite prüfen und installieren.

Ein direkter Befehl überspringt den Prüf-Prompt. Prüfen Sie die Quelle, bevor Sie ihn ausführen.

npx skills add https://github.com/a5c-ai/babysitter --skill cellranger-processor

Der Befehl bleibt in einer Zeile. Scrollen Sie horizontal, um ihn vor dem Kopieren vollständig zu prüfen.

Sie bevorzugen eine lokale Kopie? Laden Sie die Dateien herunter, die SkillsMP derzeit vorliegen.

Quelldateien prüfen

Lesen Sie SKILL.md und alle von SkillsMP angezeigten Begleitdateien, bevor Sie sich für eine Installation entscheiden.

SKILL.md

Quellanweisungen · Schreibgeschützte Vorschau

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atlas-graph-query

Reference for querying the Atlas knowledge graph through its MCP tools — the SECONDARY enrichment/comparison layer that adds best-practice context to systems you have ALREADY scanned from your real sources (`az`, repos, dirs). Use when you need to look up nodes, edges, kinds, clusters, stats, or wiki pages in Atlas to compare against your real inventory. (atlas graph, query atlas, atlas mcp, search the graph, graph neighbors, atlas record, atlas kinds, enrichment layer)

2026-06-12

atlas

Atlas turns your STATED NEED into a real systems atlas by SCANNING your actual sources (Azure via `az`, git repos, local dirs) and process/data mining them, THEN enriching against the Atlas knowledge graph. Use this skill when asked to inventory/map your real systems, scan your cloud + repos + directories, mine the real processes or data they contain, or collect their real constraints/gotchas. (atlas, scan my systems, inventory our azure account, map my repos, real systems atlas, process mining, data mining, collect nuances, system discovery)

2026-06-12

assimilate-popular-workflows

This skill should be used when the user asks to "find skills in the wild", "assimilate popular workflows", "discover SKILL.md files in repos", "research external skills", "find workflow patterns", "survey the skill landscape", "what skills exist out there", or wants to investigate public repositories for extractable processes, babysitter plugins, and reusable procedural insights. Searches GitHub for SKILL.md files, classifies repos by archetype, and maintains structured research under docs/reference-repos/.

2026-06-07

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name	cellranger-processor
description	Cell Ranger skill for 10X Genomics single-cell data processing
allowed-tools	["Read","Write","Glob","Grep","Edit","WebFetch","WebSearch","Bash"]
metadata	{"version":"1.0","category":"bioinformatics","tags":["transcriptomics","single-cell","10x-genomics","demultiplexing"]}
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