avila2026

Retrieve and analyze AlphaFold predicted structures for a protein. Use when the user provides a specific UniProt Accession ID and wants structural confidence metrics (pLDDT), domain boundary analysis, or disorder assessment. Do not use if the user only has a protein name, gene name, or amino acid sequence — ask for a UniProt ID first.

Analyzes genetic variant effects on gene expression (RNA-seq), chromatin accessibility (DNASE), histone marks (ChIP), and transcription factors using the AlphaGenome API. Use when the user asks about non-coding variant effects, pathogenicity, clinical significance, disease associations, functional effects, gene expression changes, splicing disruption, or regulatory effects in promoters and enhancers. Also use for resolving biological terms to tissue/cell-type ontologies (UBERON/CL) or analyzing variants in chr:pos:ref>alt format.

Query the ChEMBL database for bioactive molecules, drug targets, bioactivity data, approved drugs, and chemical structures. Use when the user asks about compounds, targets, IC50/Ki values, drug mechanisms, or structure searches.

Query ClinicalTrials.gov via APIv2. Use when you want to search for trials by condition, drug, location, status, or phase; retrieve trial details by NCT ID; check eligibility/inclusion criteria; count trials across conditions or time periods; identify a sponsor's trial portfolio; find recruiting trials for patient matching.

Use when needing clinical significance, pathogenicity classifications (e.g., Pathogenic, Benign, VUS), clinical evidence rationales, or finding "hard positive" benchmark controls for human genomic variants.

Use when you want to look up, map, and search for short genetic variants (SNPs, indels) in NCBI's dbSNP database. Resolves between rsIDs, genomic coordinates in VCF format, and HGVS strings. For an rsID, returns variant type, gene associations, clinical significance, allele frequencies, and genomic coordinates (GRCh38).

Query and search the EMBL-EBI Ontology Lookup Service (OLS) for biomedical ontology terms, definitions, and hierarchies across 250+ ontologies (e.g., GO, DOID, HP). Use when the user asks to search for terms, retrieve details, navigate hierarchies (parents, children, ancestors), look up properties and individuals, get autocomplete suggestions, or access ontology metadata and statistics.

Query the ENCODE Registry of cis-Regulatory Elements (cCREs) via the SCREEN GraphQL API, or make custom queries to the ENCODE Portal REST API for experiments and files (ChIP-seq peaks, etc.). Use when you want to query regulatory annotations or raw experimental data across human cell types.

Use para qualquer interacao com pacotes @21st-sdk ou 21st Agents. Se a tarefa envolver arquivos em ./agents/, provavelmente se refere ao 21st SDK.

Revisa codigo com foco em qualidade, legibilidade, manutencao e boas praticas. Use quando precisar avaliar clareza, complexidade, tratamento de erros, consistencia e riscos de manutencao.

Executa um fluxo de entrega local: validar alteracoes, commitar, subir branch e abrir pull request. Use quando quiser transformar mudancas locais em PR com seguranca e checklist minima.

Revisa se README, docs, comentarios e instrucoes estao corretos e alinhados com o comportamento real do codigo. Use quando houver mudancas de API, setup, fluxo ou uso do produto.

Analisa uma issue no GitHub e aplica labels usando o gh CLI. Use quando quiser classificar bugs, features, prioridades e duplicatas sem comentar na issue.

Use para integrar Neon Postgres com Auth0 em aplicacoes Next.js, incluindo setup do projeto, variaveis de ambiente, Drizzle ORM, rotas de autenticacao e persistencia de dados por usuario autenticado.

Use para configurar, revisar ou evoluir a integracao entre Neon e GitHub, incluindo GitHub App, secrets, variables e workflows de branch por pull request.

Use para criar, instalar, inicializar ou revisar a configuracao base de projetos Next.js com App Router, TypeScript, linting, aliases e create-next-app.

Use quando precisar parsear CSV simples para formato colunar numérico (Record<string, number[]>) sem dependências externas — ideal para upload de datasets em apps de análise.

Use quando precisar extrair um objeto JSON balanceado de uma string mista (ex: output de LLM contendo "/use_tool foo {\"data\":{\"x\":[1,2]}}"), respeitando JSON aninhado, strings escapadas e contagem de chaves.

Use quando precisar persistir state de React/SPA em localStorage com fallback automático de truncamento (FIFO em listas) quando exceder o limite de 5MB do navegador.

Use quando precisar expor um endpoint POST /api/chat (ou similar) que faz proxy para Ollama local rodando em localhost:11434, injetando system instruction e parametrizando o nível de pensamento (num_predict).

Use quando o usuário precisar de estatística descritiva (mean, std, min, max, p25, p50, p75, count) em arrays numéricos sem dependências externas — ideal para resumir colunas de datasets em dashboards ou relatórios.

Use quando precisar de 5 análises quantitativas locais (estatística descritiva, regressão linear preditiva, detecção de anomalias por z-score, otimização linear, recomendação de stack) executadas no browser ou Node, sem Python e sem chamadas de rede.

Use quando precisar renderizar gráficos inline em React baseados no tipo de análise quantitativa retornada (BarChart para descritiva, ComposedChart para regressão, ScatterChart para anomalias, cards para otimização/recomendação) usando recharts.

Use quando construir um chatbot/CLI web onde o LLM (ou o usuário) emite comandos prefixados com `/` (ex: `/criar_tarefa "X" "Y"`, `/use_tool foo {json}`) e o app precisa interpretá-los e executar handlers correspondentes.