| name | pubmed-linker |
| description | PubMed 文献链接查询与更新技能。系统化查询参考文献的 PubMed 链接、PMID、DOI，批量更新 Reference_list.md，检测开放获取状态并下载全文。需配合 MCP PubMed 工具。 |
PubMed Linker - 文献链接查询与更新
Overview
系统化使用 MCP PubMed 工具查询文献信息并更新参考文献列表的链接，支持批量处理和全文下载检测。
Available MCP Tools
pubmed_search / pubmed_quick_search — 搜索文献pubmed_get_details / pubmed_batch_query — 获取详细信息pubmed_extract_key_info — 提取关键摘要pubmed_download_fulltext / pubmed_batch_download — 下载全文 PDFpubmed_detect_fulltext — 检测开放获取状态pubmed_cross_reference — 查找相关文献
Workflow
1. 解析引用
从 Reference_list.md 提取：第一作者姓氏、题目关键词(2-3个)、期刊名、发表年份。
2. 优先级搜索策略
策略 1：作者姓氏 AND 关键词1 AND 关键词2
策略 2：期刊名[ta] AND 年份[dp] AND 关键词
策略 3：完整题目精确匹配
3. 验证匹配
匹配成功需满足：PMID 存在、作者匹配、题目相似度 >80%、年份一致、期刊匹配。
4. 更新文档
在原始引用后添加：
- **PMID**: {PMID}
- **PubMed**: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/{PMID}/
- **DOI**: https://doi.org/{DOI}
- **Fulltext**: {下载链接或状态}
5. 批量处理
- 每次处理 5-10 篇，避免超时。
- 优先使用
pubmed_batch_query。
- 维护处理进度，支持断点续传。
Error Handling
- 未找到 → 尝试不同策略 → 标注
⚠️ 未找到匹配
- 多个匹配 → 选最佳 → 若有歧义标注
⚠️ 需人工确认
- 全文不可获取 → 检测开放获取 → 标注
🔒 订阅限制
Guardrails
- 精确性优先：多条件交叉验证。
- 保留原始引用格式不修改。
- 对无法确认的信息明确标注。
- PubMed 数据库有延迟，最新文献可能未收录。
- 非 PubMed 收录文献需手动处理。
关联 Skill（网络调度协议）
| 关系 | Skill | 场景 |
|---|
| 被调用 | paper-reader | 精读后查找引用链接 |
| 被调用 | deep-research | 批量查找 PubMed 链接 |
