nextflow-pipelines

Run nf-core bioinformatics pipelines (rnaseq, sarek, atacseq) on sequencing data for gene expression, variant calling, and chromatin accessibility analyses.

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Repository: vamseeachanta/workspace-hub
Letzte Quellaktivität: 4. Mai 2026 um 15:05
Erkannte Sprache von SKILL.md: Englisch
Sterne: 16
Forks: 7

Installationsoptionen

Standardmäßig ist der Prompt ausgewählt, der zuerst die Quelle prüft. Sie können zu einem direkten Befehl wechseln oder eine lokale Kopie herunterladen.

Mit Codex oder Claude installieren Kopieren Sie diesen Prompt, fügen Sie ihn in Codex, Claude oder einen anderen Assistant ein und lassen Sie die Skill-Seite prüfen und installieren.

Ein direkter Befehl überspringt den Prüf-Prompt. Prüfen Sie die Quelle, bevor Sie ihn ausführen.

npx skills add https://github.com/vamseeachanta/workspace-hub --skill nextflow-pipelines

Der Befehl bleibt in einer Zeile. Scrollen Sie horizontal, um ihn vor dem Kopieren vollständig zu prüfen.

Sie bevorzugen eine lokale Kopie? Laden Sie die Dateien herunter, die SkillsMP derzeit vorliegen.

Quelldateien prüfen

Lesen Sie SKILL.md und alle von SkillsMP angezeigten Begleitdateien, bevor Sie sich für eine Installation entscheiden.

SKILL.md

Quellanweisungen · Schreibgeschützte Vorschau

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communication-voice

Write outbound email and external messages in Vamsee Achanta's voice — a subtle offer to help, never bold or rash claims. Load before drafting ANY email, LinkedIn/Collide reply, proposal note, or outreach sent under his name.

2026-07-30

hf-dataset-publishing

Save/publish analysis or computation results from ANY ecosystem repo to Hugging Face as a queryable, viewer-renderable dataset. Use when the user wants to "save results to hugging face", "publish dataset to HF", "hugging face data saving", "save analysis results", "hf dataset", "make results queryable", or "render via datasets-server API". Reshapes nested results into flat parquet tables, writes a dataset card with a viewer `configs:` block and provenance, applies license/public-vs-private routing, enforces a domain data-quality gate (faithful-to-source != correct), publishes to `aceengineer/<repo>-<projection>`, and verifies via the datasets-server API.

2026-07-28

github-repo-management

Clone, create, fork, configure, and manage GitHub repositories. Manage remotes, secrets, releases, and workflows. Works with gh CLI or falls back to git + GitHub REST API via curl.

2026-07-23

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name	nextflow-pipelines
description	Run nf-core bioinformatics pipelines (rnaseq, sarek, atacseq) on sequencing data for gene expression, variant calling, and chromatin accessibility analyses.
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version	1.0.0
category	science
last_updated	"2026-02-03T00:00:00.000Z"
source	https://github.com/anthropics/knowledge-work-plugins
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