| name | paper-write-sci |
| description | 根据 LaTeX 论文项目撰写、修订和润色 SCI 期刊论文，默认 AI 自主模式，也支持人机协作仅输出审查计划；提供作者风格化写作、数字事实核验、逻辑树多轮审查与 PDF/Word 渲染闭环。⚠️ 不适用：仅改格式/样式参数、纯参考文献管理、图片处理、非论文写作任务。 |
| metadata | {"author":"Bensz Conan","short-description":"SCI 论文写作与修订 skill（支持风格化、数字审查、逻辑审查）","keywords":["paper-write-sci","write-paper-sci","SCI论文写作","期刊论文","LaTeX论文","论文润色","风格化写作","数字审查","逻辑审查"]} |
Paper Write SCI
与 bensz-collect-bugs 的协作约定
- 因本 skill 设计缺陷导致的 bug，先用
bensz-collect-bugs 规范记录到 ~/.bensz-skills/bugs/，不要直接修改用户本地已安装的 skill 源码；若有 workaround，先记 bug，再继续完成任务
- 只有用户明确要求“report bensz skills bugs”等公开上报时，才用本地
gh 上传新增 bug 到 huangwb8/bensz-bugs；不要 pull 或 clone 整个仓库
用于根据 LaTeX 论文项目、Figure/Table 注释和用户补充要求，撰写或优化 SCI 期刊论文正文。
执行时优先把确定性步骤交给脚本，把启发式判断留给 AI：
- 初始化工作区、模式归一化、风格选择、计划文件命名：使用
config.yaml:scripts.prepare_workspace
- 长规则块按需从
references/ 读取；不要把所有参考文档一次性塞进上下文
目标
- 写出更像作者本人、而不是通用 AI 模板的论文
- 控制 SCI 论文语气，少用带冒号的口语化解释句，优先写成自然递进的完整句
- 在
Introduction 中协调核心观点、核心痛点和核心问题的出现频率，避免反复重提同一主张导致冗余
- 在写作与修订过程中严格保护数字、逻辑和术语一致性
- 默认直接推进修改；当用户需要人机协作时，只输出计划，不直接改论文
- 除明确约定的对外交付物外，把所有中间文件收敛到
<paper_dir>/.bensz-api/skills/paper-write-sci/{yyyy-mm-dd-hh-mm}/
输入
| 输入项 | 是否必须 | 说明 |
|---|
| 论文源代码目录 | 必须 | LaTeX 论文项目根目录 |
| Figure/Table 注释 | 必须 | 解释每张图表支撑什么论点、有哪些关键数字 |
| 用户要求 | 可选 | 例如“只改 Results”“偏保守润色”“补强 Discussion” |
| 参考论文/参考作者材料 | 可选 | 用于提炼额外风格信号，只学风格，不抄句子 |
| 运行模式 | 可选 | 默认值与别名以 config.yaml:mode 为准 |
| 风格 | 可选 | 默认值与可用列表以 config.yaml:style 为准 |
输出
autonomous
- 直接修改目标正文文件
- 将分析、审查、渲染日志写入当前运行目录
<paper_dir>/.bensz-api/skills/paper-write-sci/{yyyy-mm-dd-hh-mm}/
- 若检测到可用构建链，尝试重新渲染 PDF 和 Word
collaborative
- 只输出计划文件，文件名模式以
config.yaml:runtime_outputs.collaborative_plan_pattern 为准，默认带上本轮 run_id
- 计划中总结论文缺陷、证据、建议修复方案、影响文件和风险
- 不直接修改论文内容
- 计划以外的中间文件仍写入当前运行目录
<paper_dir>/.bensz-api/skills/paper-write-sci/{yyyy-mm-dd-hh-mm}/
模式规则
autonomous（默认）
- 发现问题就直接修复
- 采用最小必要改动原则
- 在写入任何新数字前，必须先过数字审查
- 在结束前，必须通过章节职责终审、全文一致性终审和逻辑树终审
collaborative
- 先完整读论文，再归纳缺陷和修改路径
- 计划仅作为人类审查材料，不对正文落笔
- 计划文件名、主题 slug、
run_id 和输出目录都以 config.yaml:runtime_outputs 为准
- 计划内容至少包含：问题、证据、建议动作、影响章节、关联图表、风格锚点、章节分工风险、风险说明
中间文件约束
除下列“明确约定的对外交付物”外，其余中间文件都必须放在 <paper_dir>/.bensz-api/skills/paper-write-sci/{yyyy-mm-dd-hh-mm}/：
plans/{collaborative_plan_pattern}- 论文最终构建产物，例如项目已有的 PDF 和 Word 输出
禁止再使用旧目录 .write-paper-sci/ 与更早的 .write-paper/。
风格系统
- 风格目录：
references/styles/
- 风格模板：
references/styles/style-template.md
- 默认风格以
config.yaml:style.default 为准
当前风格：
| 风格 | 领域 | 作用 |
|---|
bensz-01 | 生物医学 | 以作者风格为中心，强调问题导向、方法命名、强数字对比、详尽且对非领域读者友好的 figure legend，以及诚实局限 |
general-01 | 通用 SCI | 综合官方 SCI 写作建议，提供未指定领域时的稳健默认风格 |
风格使用原则：
- 优先使用用户显式指定的风格
- 若用户提供了参考论文或作者材料，可在所选风格基础上提炼额外信号，保存到当前运行目录的
analysis/reference-style.md
- 若用户未指定，则使用
config.yaml:style.default
- 风格服务于“更像人”，不是为了堆砌花哨句子
- 风格只能改变表达方式，不能改变事实、数字和逻辑
- 当任务是“全面润色”“重写 Discussion”或任何明显涉及
Discussion 去结果化的请求时，先用 general-01 守住章节分工底线，再叠加 bensz-01 的作者感；不要让作者风格压过章节职责
按需读取的参考文件
优先只读取当前任务所需的参考文件：
- 风格与章节写法：
references/writing-style-guide.md、references/styles/bensz-01.md、references/styles/general-01.md
- 执行护栏与通过标准：
references/execution-guards.md
- 协作计划模板：
references/collaborative-plan-template.md
- 数字审查模板：
references/templates/number-check-template.md
- 章节职责审查模板：
references/templates/section-role-check-template.md
Discussion audit 模板：references/templates/discussion-role-check-template.md- 逻辑树模板：
references/templates/logic-tree-template.md
- 逻辑审查模板：
references/templates/logic-check-template.md
读取建议：
- 涉及章节串位、
Discussion 重写或全文终审时，读取 references/execution-guards.md
- 只做风格化润色或图注润色时，优先读取
writing-style-guide.md 和目标风格文件
- 新增风格时，再读取
references/styles/style-template.md
工作流程
阶段 0：初始化
- 确认论文目录、Figure/Table 注释存在且可读
- 定位主入口 tex，优先检查
main.tex
- 扫描
\input{} 和 \include{}，建立章节路径映射
- 识别构建方式与受保护格式文件
- 运行
python3 scripts/prepare_workspace.py --paper-dir <paper_dir> [--mode ...] [--style ...] [--topic ...] [--reference-material ...]
- 根据脚本输出确认本轮
{yyyy-mm-dd-hh-mm} 目录、协作计划路径和隐藏工作区根目录
- 若有参考论文或参考作者材料，提炼补充风格信号
- 若任务涉及章节职责、数字、缩写或逻辑高风险问题，读取
references/execution-guards.md
阶段 1：理解当前论文
- 读取全文正文与关键 front/back matter
- 对照 Figure/Table 注释，提取每张图表支撑的论点
- 识别已有优质段落、薄弱段落、事实风险、风格不一致位置
- 标记章节职责风险，特别是
Introduction 泄露结果、Results 过度解释、Discussion 复述结果的段落
- 标记
Introduction 中核心观点、核心痛点、核心问题被重复表达的位置，判断哪些句子应合并、前移、后置或删除
- 初步构建逻辑树并写入当前运行目录的
analysis/logic-tree.md
- 若任务涉及全文缩写治理，按
references/execution-guards.md 建立 analysis/abbreviation-inventory.md
阶段 2：决定执行路径
collaborative
- 按
config.yaml:runtime_outputs.collaborative_plan_pattern 生成计划文件
- 计划应聚焦“缺陷与修复建议”，而不是直接给改后全文
- 计划必须显式写出
section-role risk
- 到此停止，不修改正文
autonomous
- 制定内部修订顺序
- 优先修正事实错误、数字风险和逻辑断裂
- 再做结构优化、语言润色和风格统一
阶段 3：逐节写作或修订
默认顺序：
Introduction -> Methods -> Results -> Discussion -> Conclusion ->
Additional Information -> Figure Legends -> Supplementary Materials -> Abstract
每节处理时：
- 先读现有文本和对应图表证据
- 先判断该节的章节职责，再用所选风格判断“应该怎么写更像作者”
- 写句子时少用
X: Y、This means: ...、The reason is: ... 这类冒号解释句；除方法标签、列表、图注必要标记外，优先改成自然从句、分号或独立句
- 写
Introduction 时，把核心问题、核心痛点和核心贡献分别安排在最合适的一处展开；后文只做推进或收束，不反复用近义句重说同一主张
- 若涉及长规则判断，回到
references/execution-guards.md
- 若涉及新数字，先过数字审查
- 若命中
Discussion audit 触发条件，先完成专项审查，再动笔
- 若涉及新增、删除或改写缩写，先回查
analysis/abbreviation-inventory.md
- 在
autonomous 模式下对目标 tex 做最小必要修改，并遵守 config.yaml:tex_readability
- 更新逻辑树与必要的全文一致性记录，确保局部改动没有破坏全局
处理 Figure Legends 或 Supplementary Materials 时：
- 对每个 panel 解释读图所需的最小视觉语法
- 对首次出现且不够直观的术语或缩写，补全称并给一句短定义
- 只保留帮助读图的必要方法细节，避免把整段 Methods 重复进 legend
阶段 4：终审
- 发起
section-role-check
- 完成全文一致性复核，包括数字、缩写、Figure/Table 引用与图注一致性
- 复查全文冒号解释句是否过密，特别是段首、段尾和
Introduction 贡献句
- 复查
Introduction 是否反复提及同一个核心问题、痛点或贡献；若重复没有推进逻辑，应合并或删除
- 对最新文本重建逻辑树并发起逻辑审查
- 若有阻塞性问题，修复后再复审
阶段 5：渲染与交付
按以下优先级检测构建链：
- 项目内置一键构建或导出脚本
scripts/manuscript_tool.pyMakefilelatexmk- 直接
xelatex
若存在 Word 导出链，也应尝试执行。构建日志放入当前运行目录的 render/。
约束
- 不修改
artifacts/、*.sty、*.cls、*.bst、*.bbx、*.cbx、latexmkrc
- 不改
main.tex 的结构，除非用户明确要求
- 不编造数字
- 不把缩写检查降级成“当前文件自洽”
- 不允许同一概念在不同 tex 中使用冲突缩写、冲突全称或忽有忽无的定义
- 不要为了局部简洁随意新造缩写；若新缩写不会在全文稳定复用，优先不用
- 不为“排版整齐”而重排无关段落或整节
.tex
- 不把 SCI 正文写成冒号驱动的口语化说明；冒号只用于确有必要的标签、列表、图注结构或期刊格式要求
- 不在
Introduction 中反复重提同一个核心观点、痛点或问题；每次出现都必须承担新的逻辑推进功能
- 用户要求“只改某节”时，严格限制改动范围
- 用户要求协作模式时，严格禁止直接修改论文
参考文件
- 运行准备脚本：
scripts/prepare_workspace.py
- 执行护栏：
references/execution-guards.md
- 风格模板：
references/styles/style-template.md
bensz-01：references/styles/bensz-01.mdgeneral-01：references/styles/general-01.md- 协作计划模板：
references/collaborative-plan-template.md
- 章节写作指南：
references/writing-style-guide.md
- 数字审查模板：
references/templates/number-check-template.md
- 章节职责审查模板：
references/templates/section-role-check-template.md
Discussion audit 模板：references/templates/discussion-role-check-template.md- 逻辑树模板：
references/templates/logic-tree-template.md
- 逻辑审查模板：
references/templates/logic-check-template.md
