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Skills en este repositorio

PKU-YuanGroup/OpenAI4S - Página 16

SkillsMP ha recopilado 604 skills de PKU-YuanGroup/OpenAI4S. Abre una skill para revisar su origen y sus detalles.

PKU-YuanGroup/OpenAI4S

Mostrando 4 de 604 skills recopiladas.

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Orchestrates the end-to-end spatial transcriptomics pipeline from Space Ranger / vendor output to spatial domains and statistics, branching FIRST on platform class (imaging in-situ Xenium/MERFISH/CosMx vs sequencing/capture Visium/Visium HD/Slide-seq). Use…

Idioma del texto original: inglés

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Orchestrates the end-to-end bulk short-read alternative-splicing pipeline from FASTQ to differential splicing, chaining fastp QC, cohort-consistent STAR 2-pass alignment (one shared junction DB), junction QC, event-level differential splicing (rMATS-turbo +…

Idioma del texto original: inglés

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Orchestrates an end-to-end immune-repertoire pipeline from FASTQ to clonotypes, diversity, overlap, somatic hypermutation and lineages, routing on two forks. Use when deciding bulk vs single-cell (bulk amplicon/RNA-seq -> MiXCR analyze preset ->…

Idioma del texto original: inglés

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End-to-end bulk time-course analysis from an expression matrix to temporal gene modules and per-cluster pathway enrichment. Orchestrates temporal DE (limma splines or DESeq2 LRT), Mfuzz/tslearn soft clustering of expression-profile shapes, GAM trajectory…

Idioma del texto original: inglés

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