presentation-skills-index

Skills for creating presentations, slides, and visual documentation.

Dépôt: aristoteleo/PantheonOS
Dernière activité de la source: 8 mai 2026 à 23:15
Langue détectée de SKILL.md: anglais
Étoiles: 479
Forks: 63

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atrium-desktop-driving-apps

Drive the user's Atrium desktop: open files in installed viewer apps (Viv bioimages, Vitessce/Spatial 3D omics, Mol* structures, IGV/Gosling genomics, Volume 3D, Cytoscape, MSA, PhyloTree, RDKit), read and steer ANY window — including ones the user opened — and call app backends.

2026-08-17

liveview-skills-index

Skills for opening and driving agent-controllable visualization components in the Pantheon UI sidebar — interactive viewers the agent can open, control, and read back. Viewers: Vitessce (spatial / single- cell omics), Viv (bioimage / microscopy), volume3d (3D image volumes — MIP/ISO), spatial3d (3D spatial transcriptomics), Mol*, IGV, Gosling, Cytoscape, MSA, RDKit, phylotree, plus agent-generated apps.

2026-08-17

developmental-gene-panel-design-workflow

Panel design for DEVELOPING / dynamic systems (embryonic organs, differentiation, regeneration). The target experiment is usually a LATE / terminal stage, but the biology is a trajectory: terminal cell types are end-products of earlier lineage programs. A panel built from the target stage alone resolves terminal STATES but systematically misses the developmental REGULATORS that produced them. This workflow therefore uses TWO references — the target-stage dataset (cell-state resolution) and an independent EARLIER-stage reference (developmental origin) — combines them under an explicit budget split, and benchmarks on the target stage.

2026-08-06

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