brycewang-stanford/Auto-Empirical-Research-Skills - Page 24

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Search EU-funded research outputs via the OpenAIRE Graph API

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Query the OpenAlex catalog of scholarly works, authors, and institutions

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Search PLOS open access journals with full-text Solr-powered API

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Search biomedical literature and retrieve records via PubMed E-utilities

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Access Latin American and developing world research via SciELO API

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Search papers and analyze citation graphs via OpenAlex and CrossRef APIs

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Discover open access research outputs via the SHARE notification API

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31 database search skills. Trigger: finding papers, search strategies, querying academic databases. Design: one skill per database/tool with API details, query syntax, and rate limits.

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Construct rigorous systematic search strategies for literature reviews

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Search the world's largest library catalog via OCLC WorldCat API

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Automated scientific discovery via agentic tree search by Sakana AI

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Track and compare research experiments with Aim experiment tracker

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Claude Code template for LaTeX, Beamer, and R research workflows

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Automate survey deployment, data collection, and pipeline management

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AI-driven multi-agent research assistant for end-to-end studies

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Build reproducible data science pipelines with Kedro for research projects

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Intelligent companion for ML engineering with arXiv integration

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Transform research papers into interactive AI agents for exploration

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Microsoft AI-driven R&D agent for automated data and model development

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Automate repetitive research tasks with pipelines, schedulers, and scripting

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10 research automation skills. Trigger: automating experiments, tracking results, reproducible pipelines. Design: ML experiment management, workflow orchestration, and lab automation tools.

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Automated deep research tool for thorough topic investigation

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Open deep research alternative for private data with vector search

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Autonomous agent for comprehensive deep research on any topic

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Structured methodology for conducting exhaustive multi-source investigations

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AI second brain for deep research and personal knowledge management

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Claude Code-driven autonomous AI Scientist for discovery

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Survey of LLM agents for biomedical scientific discovery

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Deep research agent searching 10+ sources with local or cloud LLMs

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Conduct qualitative meta-synthesis and evidence synthesis methods

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Open pipeline for generating deep research trajectories with LLMs

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Scoping review methodology for broad evidence mapping

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13 deep research & systematic reviews skills. Trigger: systematic reviews, multi-source synthesis, comprehensive literature surveys. Design: multi-step research protocols with quality assessment and evidence grading.

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Systematic review methodology with PRISMA and evidence synthesis

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Open-source deep research agent by Alibaba for scholarly research

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Navigate EU Horizon Europe funding programs and proposal writing

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Research data sharing and repository

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Prepare and justify research grant budgets across funding agencies

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Write competitive research proposals with clear objectives and budgets

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Search NIH-funded grants and research projects via RePORTER API

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