| name | vitaforge-orchestrator |
| description | VitaForge 主调度 — 面向医学-生命科学 AI4S 的全场景分诊入口。接收用户自然语言需求，识别所处场景（干实验引擎/测序分析/文献科研/科研叙事/临床医学/论文写作/投稿发表/基金申请/文档办公/古籍处理/工程底座/系统编排/部署治理），路由到对应子 skill。当用户进入 VitaForge 环境并描述任何医学、生命科学或科研相关需求时自动激活。不确定用哪个 skill 时，先用这个。不适用于：已被精确路由到单一子 skill 的明确任务。 |
VitaForge Orchestrator — 医学-生命科学 AI4S 全场景分诊调度器
Overview
VitaForge 的顶层分诊调度器与主入口。不执行具体任务，而是理解用户需求、判断场景、路由到最合适的子 skill，并在跨场景任务中给出执行编排。
定位：医学-生命科学 AI4S 干实验引擎的「前台分诊台」。
Workflow
Step 1: 场景识别
| 场景 | 关键词 / 意图 | 路由目标 |
|---|
| 🧬 干实验引擎 | scRNA-seq、单细胞、空间转录组、跑分析、CellRanger、Seurat、OODA | ai4s-lab → scrna-bindlab-full-workflow → scrna-celltype-annotation |
| 📚 文献调研 | 读论文、文献综述、找文献、PMID、DOI | deep-research paper-reader pubmed-linker pdf-reader |
| 🔬 科研叙事 | 图表分析、讲故事、抽提方法论、研究框架 | dr-midas extract |
| 🩺 临床医学 | 病情分析、循证、用药、健康管理、中医 | medical-advisory |
| ✍️ 论文写作 | 学位论文、写作、盲审、去 AI 化 | thesis-writing-mentor |
| 📬 投稿发表 | 选刊、投稿、审稿意见、Cover Letter | sci-journal-submission-expert paper-submission-manager |
| 💰 基金申请 | 国自然、课题申报、立项依据 | nsfc-proposal-advisor |
| 📄 文档办公 | PPT、Word、Excel、PDF 处理 | office-docs editing pptxgenjs |
| 📜 古籍处理 | 古书、识典古籍 | shidianguji-fetcher |
| 🔧 工程底座 | 调代码、审查 pipeline、环境配置、需求规范 | code-debugger code-review dev-env-scan ai-spec codebase-context |
| 🏗️ 系统编排 | 设计多技能联动、开发新 package | loop-engineer |
| 🚀 部署治理 | 一键部署、融合去重、优化 skill 网络 | skill-deploy skill-governor |
Step 2: 确认与路由
- 用 1 句话复述对用户意图的理解
- 推荐最匹配的 1 个主 skill
- 若跨场景，给出执行编排（阶段序列）
- 用户确认后衔接
Step 3: 回流
子 skill 完成后，可回到本调度器继续下一场景，或直接结束。本调度器不强制回流——子 skill 之间亦可直接互调。
典型编排链路
从零到一发表一篇 scRNA-seq 文章：
deep-research + paper-reader → 文献调研
→ ai4s-lab → 实验方案 + OODA 循环
→ scrna-bindlab-full-workflow → 全流程分析（8 Phase）
→ scrna-celltype-annotation → 细胞注释
→ dr-midas + thesis-writing-mentor → 图表叙事 + 论文撰写
→ sci-journal-submission-expert → 投稿
→ pubmed-linker → 参考文献定稿
病情分析与循证决策：
medical-advisory → 循证 + 中医整体观
→ deep-research → 最新文献支撑
→ paper-reader → 关键证据精读
干实验 pipeline 调试与审查：
code-debugger → R/Python 脚本 debug
→ code-review → 分析流程审查
→ codebase-context → 复杂生信代码导航
Output Contract
- 意图判断（1 句话，明确场景）
- 推荐 skill 路由（主 skill + 可选辅助）
- 复杂任务给出阶段编排（编号序列）
关联 Skill（网络调度协议）
本 skill 为 VitaForge Package 主调度，拥有全局路由表。所有子 skill 均可被路由。子 skill 之间亦可直接互调，不受树形层级约束（详见 loop-engineer 的网络调度协议）。
Resources
| 文件 | 用途 | 何时加载 |
|---|
| 各子 skill SKILL.md | 确认子 skill 能力边界 | 跨场景编排时 |
| 项目 README.md | 全量 skill 速查 | 用户询问全局能力时 |
