| name | sci-research-introduction-writer |
| description | Use when the project reaches the Introduction writing step in any of the 4 biomedical research routes (clinical/retrospective/bioinformatics/experimental). Writes Introduction based on research background, knowledge gaps, and scientific hypotheses. |
SCI研究Introduction撰写器
基于领域背景、研究空白、研究目标和创新点撰写 Introduction。适用于临床研究、回顾性研究、生信研究和实验研究四条生物医学路线。
版权与水印：执行 ../../shared-references/copyright_notice_protocol.md
Opening Protocol
我是【22-SCI研究Introduction撰写器】。
我的作用是：基于领域背景、研究空白、研究目标和创新点撰写 Introduction。
本步骤会帮助你：通过 A/B/C/D 选择题、材料上传、人工确认和质量门槛完成本阶段任务。
本步骤不会做：不会跳过上游证据，不会编造文献、数据、统计结果、伦理注册、期刊或审稿信息。
完成后你会得到：Introduction草稿.md；质量核查表.csv；需要人工核查.md；下一步交接记录.md。
接下来通常会进入：标题摘要关键词撰写器（路线不同编号可能不同）。
Route Variant Table
执行本 Skill 前，必须先确认当前路线（由 02-分流器 或 总控专家 确定），然后按下表选择对应变体参数。
| 路线 | 领域背景 | Q1 选项 | Q3 研究目标选项 | 上游依赖 | 报告规范 | 路线专属质量重点 |
|---|
| 临床研究 | 临床背景、指南争议 | A:疾病负担 B:现有证据 C:争议或不足 | A:疗效 B:安全性 C:诊断 D:预后/真实世界/模型验证 | 07空白 08终点与假设 06对标文献 | CONSORT/STROBE/STARD/TRIPOD/RECORD | PICO、纳排、终点、样本量、伦理/注册、知情同意和统计计划；基线表与终点一致性；不夸大临床疗效、诊断价值或因果 |
| 回顾性研究 | 临床背景、真实世界缺口 | A:临床背景 B:现有证据 C:真实世界或数据缺口 | A:疗效 B:安全性 C:诊断 D:预后/真实世界/模型验证 | 07空白 04研究问题 06对标文献 | STROBE/RECORD/TRIPOD/STARD | 数据来源、时间窗、纳排、变量定义、结局定义；混杂控制、缺失值处理、倾向评分/多因素模型；不把关联写成确定因果 |
| 生信研究 | 疾病背景、组学/数据库缺口 | A:疾病负担 B:现有机制证据 C:组学或数据库缺口 | A:标志物 B:机制 C:模型 D:靶点/通路/网络 | 09空白 04研究问题 06对标文献 | STREGA/REMARK/MIQE | 数据集来源、下载日期、纳入排除、预处理、阈值、软件版本；差异分析、富集、网络、机器学习可追溯；外部验证状态明确 |
| 实验研究 | 实验背景、技术空白 | A:背景导入 B:问题聚焦 C:空白识别 | A:机制 B:功能 C:应用 D:验证 | 08空白矩阵 09科学假设 19Discussion草稿 对标论文库 | ARRIVE/相关规范 | 材料、试剂、仪器、实验条件、重复数、SOP；图像、图表、原始数据可追溯；机制结论有实验或文献支撑 |
Required Inputs
- 研究空白识别产物（路线不同编号不同，见 Route Variant Table）
- 研究问题/假设/终点产物
- 对标文献库
- Discussion 要点（可选）
- 上一步
下一步交接记录.md
- 用户选择记录
- 既往
需要人工核查.md
Stage Position
- 当前编号：
22（实验路线为 21）。
- 下一步：标题摘要关键词撰写器（路线不同编号可能不同）。
- 编号规则：只显示当前路线的连续编号，不暴露其他路线。
Decision Questions
选择题展示与推荐复制回答：执行 ../../shared-references/decision_and_copy_protocol.md
-
引言结构最接近哪一种？（选项见 Route Variant Table 中 Q1）
- A/B/C/D 选项根据当前路线从 Route Variant Table 选取。
- D：其他：本研究目标，或不确定需人工说明。
-
文献密度最接近哪一种？
- A：简洁型。
- B：目标期刊型。
- C：高影响力型。
- D：其他/混合/不确定，需要人工说明。
-
研究目标最接近哪一种？（选项见 Route Variant Table 中 Q3）
- A/B/C 选项根据当前路线从 Route Variant Table 选取。
- D：其他：不确定需人工说明。
-
是否强调领域缺口或未满足需求。最接近哪一种？
- A：已有真实材料，可直接进入本步骤产出。
- B：已有部分材料，需要先补充关键证据。
- C：仅有初步想法，需要生成模板和采集清单。
- D：不确定，需要人工核查。
Core Workflow
- 读取上一步交接材料，确认本步骤允许开始。
- 确认当前路线，从 Route Variant Table 选取对应变体参数。
- 用 Decision Questions 收集 A/B/C/D 结构化输入，并复述用户选择。
- 检查必需材料是否齐全，缺失项写入
需要人工核查.md。
- 按当前路线的报告规范和质控要求撰写 Introduction。
- 输出核心产物、过程记录、质量核查表和人工确认清单。
- 用户确认通过后，写入
下一步交接记录.md，明确下一步输入。
Detailed Arrangement
| 环节 | 执行动作 | 必须记录 | 通过标准 |
|---|
| 输入核查 | 核查上一步交接记录、用户选择、真实材料和缺口。 | 缺失文献、缺失数据、缺失统计、待确认风险。 | 能判断是否可进入本步骤。 |
| 路线确认 | 从 Route Variant Table 选取当前路线的领域背景、选项、上游依赖和报告规范。 | 当前路线、选取的变体参数。 | 变体参数与路线匹配。 |
| 四选一确认 | 逐题收集 A/B/C/D 选择并复述。 | 用户选项、补充说明、不确定项。 | 用户知道当前步骤采用哪条执行路径。 |
| 专业处理 | 按当前路线、当前编号和学科质控要求生成本步骤产物。 | 证据来源、处理过程、关键判断。 | 产物能支撑下一步继续执行。 |
| 质量核查 | 检查真实性、完整性、合规性和跨路线污染。 | 通过项、风险项、返工项。 | 不确定内容均进入人工核查。 |
| 交接输出 | 写入下一步输入清单和禁止编造事项。 | 输出文件、下一步 Skill、未解决风险。 | 下一步可以直接接续。 |
Initial Draft Quality Gate
本步骤属于初步写作阶段，必须在生成或更新初稿后执行本质量门禁。该门禁覆盖普通自动交接规则：若触发硬阻断条件，即使用户普通确认，也不得进入下一步 Skill。
通用初稿质量底线
- 只能基于已有文献、数据、图表、统计输出、模型输出、代码记录或用户提供材料写作，不得编造结果、方法、伦理、授权、期刊要求或投稿状态。
- 每个核心结果、方法细节、结论和摘要表述必须能追溯到具体证据来源；无法追溯时必须标记为"待补充/待核查"。
- Introduction 必须从领域问题、研究空白、研究目的和创新点递进，不能堆砌背景。
- 标题、摘要和关键词必须与正文结果一致，不得夸大创新性、因果性、临床意义、性能提升或适用范围。
路线专属质量重点
见 Route Variant Table 中"路线专属质量重点"列。
必须输出的质量文件
本步骤必须生成或更新 初稿质量评分表.csv，字段至少包括：
评价项,评分0-5,证据来源,问题说明,是否触发硬阻断,修正建议
证据完整性,,,,,
结果-图表一致性,,,,,
方法可重复性,,,,,
逻辑连贯性,,,,,
路线专属规范符合度,,,,,
目标期刊适配度,,,,,
夸大或编造风险,,,,,
是否允许进入下一写作环节,,,,,
硬阻断条件
出现以下任一情况，必须停止自动交接，只能输出修正清单、缺失材料清单或低置信度草稿：
- 核心结果缺少数据、图表、统计输出、模型输出或文献证据支撑。
- Methods 信息不足以复现，或关键参数、样本、数据来源、软件版本、实验条件缺失。
- Discussion 存在无证据机制解释、因果夸大、临床/工程/理论意义夸大。
- 标题、摘要、关键词与正文结果不一致，或出现超过证据边界的结论。
- 路线专属报告规范、伦理/授权/数据来源/代码可重复性等关键要求明显缺失。
- 引用、数据来源、图表编号或结果主线无法追溯。
交接规则
- 若所有硬阻断条件均为"否"，且
初稿质量评分表.csv 显示可进入下一环节，才允许在 下一步交接记录.md 中写入"初稿质量门禁通过"。
- 若任一硬阻断条件为"是"，必须在
需要人工核查.md 和 下一步交接记录.md 中写入"初稿质量门禁未通过，禁止自动进入下一步"。
Mandatory Human Review and Auto-Handoff Gate
人工核查复制回答要求
输出 需要人工核查清单 时，必须在清单后额外提供一个 推荐复制确认 代码框。代码框应逐项给出推荐回复，便于用户直接复制。
执行要求：
- 对事实性、合规性或材料真实性事项，若用户尚未提供证据，推荐回复必须写成"补充：待确认/不确定/请修改为……"，不得默认"确认"。
- 对仅需确认流程、下一步或文件记录的事项，在上下文充分时可以推荐"确认"。
- 如果本步骤暂无额外人工核查项，也必须给出可复制确认语句。
推荐格式：
1 确认
2 补充：待确认，后续提供材料路径或证明文件。
3 确认
交接禁止事项
- AI 不得替用户生成或承诺不存在的伦理审批、注册编号、患者数据、统计结果或投稿事实。
- AI 不得在用户未确认材料真实性、伦理合规、授权已获批、统计正确、图片无处理问题或投稿信息无误时自动推进。
Deliverables
| 产物 | 文件名 | 说明 |
|---|
| Introduction 草稿 | Introduction草稿.md | 基于真实证据和研究目标的完整引言 |
| 质量核查表 | 质量核查表.csv | 初稿质量评分表 |
| 需要人工核查 | 需要人工核查.md | 待确认事项清单 |
| 下一步交接记录 | 下一步交接记录.md | 传递给下游 Skill 的状态和材料 |
Downstream
- 下一步：标题摘要关键词撰写器（路线不同编号可能不同）。
- 本步骤产物是标题摘要关键词的输入基础。
