esmfold2
Predict quick protein structures with ESMFold-style workflows. Use when a task needs fast MSA-free folding, sequence triage, variant structure screening, or confidence review.
ソース情報
- リポジトリ
- Companion-Inc/feynman
- ソースの最終更新活動
- 2026年7月5日 14:46
- 検出された SKILL.md の言語
- 英語
- スター
- 9,734
- フォーク
- 1,083
インストール方法
デフォルトでは、最初にソースを確認する Prompt が選択されています。直接コマンドに切り替えるか、ローカルコピーをダウンロードすることもできます。
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SKILL.md
ソースの指示 · 読み取り専用プレビュー- name
- esmfold2
- description
- Predict quick protein structures with ESMFold-style workflows. Use when a task needs fast MSA-free folding, sequence triage, variant structure screening, or confidence review.
# ESMFold2
Use this skill when a fast protein fold hypothesis is useful before heavier structure prediction.
Workflow:
1. Normalize sequences into FASTA and record identifiers, mutations, truncations, domains, and oligomer assumptions.
2. Verify the local or endpoint route before running.
3. Save FASTA, model version, command or request body, predicted PDB/mmCIF, pLDDT/confidence outputs, and logs.
4. Flag low-confidence regions, missing multimers, disorder, membrane regions, and sequence lengths outside the chosen route's limits.
5. Use RDKit/3Dmol/PDB previews and source-backed comparisons when the output influences a research decision.
Use ESMFold-style predictions for triage unless an independent check supports the structural claim.
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