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HERRY423
GitHub クリエイタープロフィール

HERRY423

2 件の GitHub リポジトリにある 26 件の収集済み skills をリポジトリ単位で表示します。

収集済み skills
26
リポジトリ
2
更新
2026-07-28
リポジトリエクスプローラー

リポジトリと代表的な skills

grade-sof
疫学者

用于给一个 outcome 的证据确定性做 GRADE 评级、产出 Summary of Findings (SoF) 表。触发:证据确定性、certainty of evidence、GRADE、证据质量分级、这个结论有多可靠、SoF 表、summary of findings、要不要下推荐、指南证据分级、quality of evidence、能不能信这个结论、证据强度、evidence certainty、把证据评个级。也用于"这个疗法的证据到底有多强"、"帮我给这几个结局评 GRADE"、"这条推荐的证据基础可靠吗"。禁用于:单纯核对某个 PMID 真伪(那用 evidence-audit / evidence_verify)。

2026-07-10
crossmodal-discovery
その他の生物科学者

Use for cross-modal target discovery from an unmet clinical need, combining literature, genetics, druggability, clinical trials, single-cell, and spatial evidence in one auditable context.

2026-07-10
experimental-design
医学科学者(疫学者除く)

Design executable biomedical experiments from literature gaps or hypotheses, including testability, power, protocol, reagents, cost, preregistration, and failure modes.

2026-07-10
causal-knowledge-graph
その他の生物科学者

Persist and query biomedical causal triples from BioCSSwitch conversations, literature checks, and debate outputs.

2026-07-10
sensitive-mode
医療情報技術者・医療記録担当者

用于任何**可能含患者数据 / 临床原始记录 / 医疗档案**的场景,强制先做 PHI 检测再决定去向。触发:患者、病历、病案、临床数据、EHR、EMR、住院记录、门诊记录、handover note、progress note、discharge summary、SOAP、真实世界数据、RWD、reidentification、identifiable data、真实病人、我这里有一段病历、这是一份体检报告、帮我看一下这份 CT 报告、我上传一份门诊记录、患者档案、患儿、受试者数据、subject-level data、临床原始表、GCP 数据、eCRF、我要处理 HIPAA、PHI、脱敏、去标识化、我们医院的数据。也在提到 sensitive_mode / 敏感模式 / 隐私模式 时触发。禁用于:公开文献 / 已发表数据 —— 那些不含 PHI,扫描是浪费时间。

2026-07-10
research-partner
その他の生物科学者

Use when the user opts into a local research-interest model, wants personalized paper/preprint/trial updates, saves or rejects research suggestions, asks for a proactive briefing, or wants workflow prediction across sessions.

2026-07-10
single-cell-prep
その他の生物科学者

用于单细胞 RNA-seq 数据的标准化预处理、QC、doublet 检测、batch 整合、基因 ID 转换、细胞类型注释与内容指纹,为下游聚类、scFM embedding、DEG、轨迹或细胞通信准备可复现输入。触发:单细胞预处理、scRNA-seq QC、scanpy 预处理、AnnData、h5ad、质控、doublet、Scrublet、scDblFinder、batch correction、Harmony、scVI、BBKNN、基因 ID 转换、CellTypist、SingleR、CITE-seq、multiome、空间转录组、Visium。禁用于:bulk RNA-seq(用 geo-triage / omics_deseq2),以及 embedding 之后的 DEG/trajectory/cell communication(交给 sc-downstream-analysis)。

2026-07-10
grant-specific-aims
その他の高等教育教員

用于写基金标书的 Specific Aims 页 / R01 aims / K award / NSFC 项目摘要 / significance section。触发:Specific Aims、aims page、NIH R01、R21、K award、NSFC、国自然、自然科学基金、基金标书、grant proposal、写标书、项目摘要、significance and innovation、grant aims、fellowship aims、专项基金申请书、青年基金、面上项目、重点项目。禁用于:全文 grant writing(那需要 methods / budget / biosketch,超出 skill 范围)。

2026-07-10
このリポジトリの収集済み skills 22 件中、上位 8 件を表示しています。
claim-verification
その他の生物科学者

把一份分析报告、手稿草稿或结论段落拆成原子陈述,逐条打到权威数据库与文献核验,并标注每条的支持/反驳/无证据状态。当用户要求核查结论、验证结果、检查引用是否属实、审阅手稿的事实性、或问"这些数字可靠吗"时使用。也在提交前的最后一道自查时使用。

2026-07-28
controlled-data-protocol
医学科学者(疫学者除く)

处理受控访问的人类数据(dbGaP、All of Us、UK Biobank、EGA、TCGA controlled)时的合规操作规程。当用户提到这些数据源、提到 TRE/RAP/Workbench、问"能不能用 AI 分析患者数据"、需要申请数据访问、或需要把分析提交进安全计算环境时使用。

2026-07-28
deterministic-pipeline
ソフトウェア開発者

把一个分析需求写成可复现的 Nextflow 或 Snakemake 工作流,含测试、容器 digest 固定、参考版本固定、provenance 输出。当用户要求做 RNA-seq/WGS/WES/ATAC-seq/单细胞分析、跑 nf-core 流程、批量处理测序数据、或需要"可复现的分析流程"时使用。也在需要把一段探索性 notebook 固化成生产流程时使用。

2026-07-28
kg-hypothesis
その他の生物科学者

从生物医学知识图谱生成可检验假设。当用户要求提出研究假设、寻找机制解释、做靶点发现、药物重定位、或问"X 和 Y 之间可能有什么联系"时使用。也在需要为一个观察到的表型找候选通路时使用。

2026-07-28
2 件中 2 件のリポジトリを表示
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