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その他コンピュータ職
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Set up, launch, validate, and troubleshoot the scVI ToolUniverse remote tool and optionally relay it through ToolUniverse Connect. Use when deploying or auditing this implementation.
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このリポジトリの skills
mims-harvard/ToolUniverse - 3ページ
SkillsMP は mims-harvard/ToolUniverse から 374 件の skill を収集しています。skill を開くとソースと詳細を確認できます。
mims-harvard/ToolUniverse収集済み skill 374 件中 40 件を表示しています。
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ソフトウェア開発者
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Set up, launch, validate, and troubleshoot the SingleR ToolUniverse remote tool and optionally relay it through ToolUniverse Connect. Use when deploying or auditing this implementation.
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ソフトウェア開発者
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Set up, launch, validate, and troubleshoot the Slingshot ToolUniverse remote tool and optionally relay it through ToolUniverse Connect. Use when deploying or auditing this implementation.
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ソフトウェア開発者
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Set up, launch, validate, and troubleshoot the Squidpy ToolUniverse remote tool and optionally relay it through ToolUniverse Connect. Use when deploying or auditing this implementation.
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ソフトウェア開発者
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Set up, launch, validate, and troubleshoot the Tangram ToolUniverse remote tool and optionally relay it through ToolUniverse Connect. Use when deploying or auditing this implementation.
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ソフトウェア開発者
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Set up, launch, validate, and troubleshoot the TranscriptFormer ToolUniverse remote tool and optionally relay it through ToolUniverse Connect. Use when deploying or auditing this implementation.
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ソフトウェア開発者
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Set up, launch, validate, and troubleshoot the USPTO downloader ToolUniverse remote tool and optionally relay it through ToolUniverse Connect. Use when deploying or auditing this implementation.
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疫学者
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Detect and analyze adverse drug event signals using FDA FAERS reports, drug labels, and disproportionality statistics (PRR, ROR, IC). Generates quantitative safety signal scores (0-100) with evidence grading. Use for post-market surveillance,…
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疫学者
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Detect and analyze adverse drug event signals using FDA FAERS reports, drug labels, and disproportionality statistics (PRR, ROR, IC). Generates quantitative safety signal scores (0-100) with evidence grading. Use for post-market surveillance,…
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疫学者
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Detect and analyze adverse drug event signals using FDA FAERS reports, drug labels, and disproportionality statistics (PRR, ROR, IC). Generates quantitative safety signal scores (0-100) with evidence grading. Use for post-market surveillance,…
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その他の生物科学者
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Phylogenetic analysis — de novo multiple sequence alignment (Clustal Omega/MUSCLE/MAFFT via EBI_msa_align) and neighbour-joining/UPGMA tree building (EBI_build_phylogenetic_tree) from your own sequences, plus tree analysis, treeness, saturation (PhyKIT),…
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その他の生物科学者
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Answer biomedical FACTUAL / recall / multiple-choice questions by querying ToolUniverse database tools instead of answering from memory. Triggers on any 'which gene/drug/variant/disease/pathway/miRNA/TF...' lookup, any question phrased 'according to…
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医学科学者（疫学者除く）
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Comprehensive drug profiling — mechanism, primary/secondary targets, drug interactions, clinical-trial status, adverse events (FAERS), pharmacogenomics, and approval history. Use for full drug investigation reports, 'tell me about drug X' queries, and…
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職業分類
その他の生物科学者
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Gene-set enrichment analysis — GO (Biological Process, Molecular Function, Cellular Component), KEGG, Reactome pathway enrichment via clusterProfiler, gseapy, ORA, GSEA. Use for interpreting DEG lists, screen hit lists, or any gene-list-to-pathways query.…
原文の言語: 英語
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職業分類
その他の生物科学者
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Comprehensive disease characterization across genomics, transcriptomics, proteomics, and pathways for systems-level understanding. Identifies therapeutic opportunities and biomarker candidates by integrating multi-layer molecular data. Use for full-omics…
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職業分類
医学科学者（疫学者除く）
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Comprehensive drug-target intelligence — tissue expression (GTEx, HPA), pathways, protein interactions (STRING), variant landscape (ClinVar, gnomAD), druggability (DGIdb, ChEMBL approved drugs). 9 parallel research paths with citations. Use for full target…
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医学科学者（疫学者除く）
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Comprehensive drug profiling — mechanism, primary/secondary targets, drug interactions, clinical-trial status, adverse events (FAERS), pharmacogenomics, and approval history. Use for full drug investigation reports, 'tell me about drug X' queries, and…
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その他の生物科学者
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Gene-set enrichment analysis — GO (Biological Process, Molecular Function, Cellular Component), KEGG, Reactome pathway enrichment via clusterProfiler, gseapy, ORA, GSEA. Use for interpreting DEG lists, screen hit lists, or any gene-list-to-pathways query.…
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その他の生物科学者
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Comprehensive disease characterization across genomics, transcriptomics, proteomics, and pathways for systems-level understanding. Identifies therapeutic opportunities and biomarker candidates by integrating multi-layer molecular data. Use for full-omics…
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職業分類
医学科学者（疫学者除く）
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Comprehensive drug-target intelligence — tissue expression (GTEx, HPA), pathways, protein interactions (STRING), variant landscape (ClinVar, gnomAD), druggability (DGIdb, ChEMBL approved drugs). 9 parallel research paths with citations. Use for full target…
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職業分類
その他の生物科学者
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Gene-set enrichment analysis — GO (Biological Process, Molecular Function, Cellular Component), KEGG, Reactome pathway enrichment via clusterProfiler, gseapy, ORA, GSEA. Use for interpreting DEG lists, screen hit lists, or any gene-list-to-pathways query.…
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その他の生物科学者
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Comprehensive disease characterization across genomics, transcriptomics, proteomics, and pathways for systems-level understanding. Identifies therapeutic opportunities and biomarker candidates by integrating multi-layer molecular data. Use for full-omics…
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データサイエンティスト
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ToolUniverse plugin router. STEP 1 BEFORE ANY ANALYSIS: if the data folder contains `*_executed.ipynb`, run `tu run read_executed_notebook '{"data_folder":"<path>","search":"<keyword>"}'` to extract its cell outputs and apply EVERY filter/sample-exclusion the…
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職業分類
その他コンピュータ職
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Install the ToolUniverse Claude Code plugin in one step — provides MCP server with 1000+ scientific tools, 120+ research skills, slash commands, hooks, and the research agent. Use for first-time plugin install, troubleshooting plugin not loading, verifying…
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ソフトウェア品質保証アナリスト・テスター
説明
Review existing work against the user's actual goal and surface evidence-backed strengths, gaps, risks, and next fixes. Use when asked to eval, evaluate, review, assess, or check current/this/my/our work; decide whether a task is complete; build a…
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データサイエンティスト
説明
ToolUniverse plugin router. STEP 1 BEFORE ANY ANALYSIS: if the data folder contains `*_executed.ipynb`, run `tu run read_executed_notebook '{"data_folder":"<path>","search":"<keyword>"}'` to extract its cell outputs and apply EVERY filter/sample-exclusion the…
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ソフトウェア品質保証アナリスト・テスター
説明
Review existing work against the user's actual goal and surface evidence-backed strengths, gaps, risks, and next fixes. Use when asked to eval, evaluate, review, assess, or check current/this/my/our work; decide whether a task is complete; build a…
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その他の生物科学者
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Evaluate the human safety liability of knocking down, knocking out, degrading, or pharmacologically inhibiting a gene. Use for gene safety scoring, on-target toxicity assessment, essentiality and genetic-constraint review, critical-organ expression analysis,…
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その他の生物科学者
説明
Evaluate the human safety liability of knocking down, knocking out, degrading, or pharmacologically inhibiting a gene. Use for gene safety scoring, on-target toxicity assessment, essentiality and genetic-constraint review, critical-organ expression analysis,…
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その他の生物科学者
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Evaluate the human safety liability of knocking down, knocking out, degrading, or pharmacologically inhibiting a gene. Use for gene safety scoring, on-target toxicity assessment, essentiality and genetic-constraint review, critical-organ expression analysis,…
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医学科学者（疫学者除く）
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Comprehensive ADMET (Absorption, Distribution, Metabolism, Excretion, Toxicity) profiling for drug candidates. Integrates ADMET-AI predictions, SwissADME drug-likeness, PubChemTox experimental toxicity, ChEMBL clinical data, Lipinski rule-of-five, and CYP…
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職業分類
医学科学者（疫学者除く）
説明
Comprehensive ADMET (Absorption, Distribution, Metabolism, Excretion, Toxicity) profiling for drug candidates. Integrates ADMET-AI predictions, SwissADME drug-likeness, PubChemTox experimental toxicity, ChEMBL clinical data, Lipinski rule-of-five, and CYP…
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職業分類
その他コンピュータ職
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Install, set up, verify, update, pin, uninstall, or troubleshoot the ToolUniverse plugin on Google Antigravity (AGY / Antigravity IDE / Antigravity 2.0). ALWAYS consult this skill for any of those — don't answer from memory, because the exact CLI name (agy),…
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職業分類
その他の生物科学者
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Build and interpret polygenic risk scores (PRS) for complex diseases using GWAS summary statistics. Covers PRS construction (clumping/thresholding, PRS-CS), validation in independent cohorts, ancestry-aware adjustment, and clinical interpretation…
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職業分類
医学科学者（疫学者除く）
説明
Cancer treatment recommendations from molecular profile (mutations + cancer type + biomarkers) — FDA-approved + investigational therapies, resistance mechanisms, matching clinical trials, prognosis. Uses CIViC, ClinVar, OpenTargets, ClinicalTrials.gov. Use…
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職業分類
その他の生物科学者
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Protein-protein interaction (PPI) network analysis — STRING (predicted + experimental), BioGRID (curated), SASBDB (small-angle scattering). Distinguishes physical interactions (binding) from functional associations (co-expression, co-regulation). Use for…
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病理科医師
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Rare disease differential diagnosis from patient phenotype — HPO term matching to candidate diseases (Orphanet, OMIM), gene panel prioritization, ACMG variant interpretation, and structure-based variant analysis. Use for diagnostic odyssey assistance,…
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社会科学研究助手
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Statistical modeling — linear/logistic/ordinal/Poisson regression, ANOVA, Kruskal-Wallis, chi-square, Mann-Whitney, Cox survival, spline fits (R `ns()`), odds ratios, Cohen's d, F-statistic, p-value computation. Specializes in clinical-trial AE analysis (SDTM…
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職業分類
その他の生物科学者
説明
Build and interpret polygenic risk scores (PRS) for complex diseases using GWAS summary statistics. Covers PRS construction (clumping/thresholding, PRS-CS), validation in independent cohorts, ancestry-aware adjustment, and clinical interpretation…
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職業分類
医学科学者（疫学者除く）
説明
Cancer treatment recommendations from molecular profile (mutations + cancer type + biomarkers) — FDA-approved + investigational therapies, resistance mechanisms, matching clinical trials, prognosis. Uses CIViC, ClinVar, OpenTargets, ClinicalTrials.gov. Use…
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収集済み skill 374 件中 40 件を表示しています。