lamindb
This skill should be used when working with LaminDB, an open-source data framework for biology that makes data queryable, traceable, reproducible, and FAIR. Use when managing biological datasets (scRNA-seq, spatial, flow cytometry, etc.), tracking computational workflows, curating and validating data with biological ontologies, building data lakehouses, or ensuring data lineage and reproducibility in biological research. Covers data management, annotation, ontologies (genes, cell types, diseases, tissues), schema validation, integrations with workflow managers (Nextflow, Snakemake) and MLOps platforms (W&B, MLflow), and deployment strategies.
ソース情報
- リポジトリ
- x-cmd/skill
- ソースの最終更新活動
- 2026年1月30日 12:43
- 検出された SKILL.md の言語
- 英語
- スター
- 26
- フォーク
- 5
インストール方法
デフォルトでは、最初にソースを確認する Prompt が選択されています。直接コマンドに切り替えるか、ローカルコピーをダウンロードすることもできます。
ソースファイルを確認
インストールを決める前に、SKILL.md と SkillsMP に表示されている付属ファイルをお読みください。
SKILL.md を表示中
| name | lamindb |
|---|---|
| description | This skill should be used when working with LaminDB, an open-source data framework for biology that makes data queryable, traceable, reproducible, and FAIR. Use when managing biological datasets (scRNA-seq, spatial, flow cytometry, etc.), tracking computational workflows, curating and validating data with biological ontologies, building data lakehouses, or ensuring data lineage and reproducibility in biological research. Covers data management, annotation, ontologies (genes, cell types, diseases, tissues), schema validation, integrations with workflow managers (Nextflow, Snakemake) and MLOps platforms (W&B, MLflow), and deployment strategies. |
