bio-virtual-screening
Performs structure-based virtual screening using AutoDock Vina, SMINA, GNINA (CNN scoring), and DiffDock-L hybrid workflows with explicit choice rules across rigid vs flexible docking, cross-docking vs self-docking, binding-site detection (P2Rank, fpocket), receptor preparation (PDB2PQR, PROPKA), ligand preparation (meeko, OpenBabel), and ultralarge-library screening (ZINC22, Enamine REAL). Use when screening chemical libraries against a protein target to find candidate binders, ranking docking poses, or selecting a docking workflow for a specific scenario.
소스 정보
- 저장소
- GPTomics/bioSkills
- 최근 소스 활동
- 2026년 7월 15일 00:46
- 감지된 SKILL.md 언어
- 영어
- 스타
- 1,235
- 포크
- 274
설치 방법
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소스 지침 · 읽기 전용 미리보기| name | bio-virtual-screening |
|---|---|
| description | Performs structure-based virtual screening using AutoDock Vina, SMINA, GNINA (CNN scoring), and DiffDock-L hybrid workflows with explicit choice rules across rigid vs flexible docking, cross-docking vs self-docking, binding-site detection (P2Rank, fpocket), receptor preparation (PDB2PQR, PROPKA), ligand preparation (meeko, OpenBabel), and ultralarge-library screening (ZINC22, Enamine REAL). Use when screening chemical libraries against a protein target to find candidate binders, ranking docking poses, or selecting a docking workflow for a specific scenario. |
