scientific-pharmacogenomics

name	scientific-pharmacogenomics
description	ファーマコゲノミクス (薬理ゲノム学) 解析スキル。PharmGKB/ClinPGx による 遺伝子-薬物相互作用照会、CPIC ガイドライン取得・解釈、Star アレル分類、 代謝酵素表現型判定 (PM/IM/NM/RM/UM)、FDA 薬理ゲノムバイオマーカー、 投与量レコメンデーション、PGx レポート生成を統合した 個別化薬物療法支援パイプライン。
tu_tools	[{"key":"fda_pharmacogenomic_biomarkers","name":"FDA PGx Biomarkers","description":"FDA 薬理ゲノミクスバイオマーカーテーブル"}]

Scientific Pharmacogenomics

遺伝子型に基づく薬物選択・用量調整を支援する ファーマコゲノミクスパイプライン。CPIC/DPWG ガイドライン・PharmGKB・ FDA PGx バイオマーカーのデータベース照会と解釈を統合。

When to Use

• 遺伝子型に基づく薬物選択・投与量調整が必要なとき
• CPIC/DPWG ガイドラインの系統的照会が必要なとき
• Star アレル分類・代謝酵素表現型 (PM/IM/NM/RM/UM) を判定するとき
• FDA 承認ファーマコゲノミクスバイオマーカーを確認するとき
• 個別化薬物療法レポートを生成するとき

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Quick Start

1. 遺伝子-薬物相互作用照会

import pandas as pd
import json


def query_gene_drug_interactions(gene_symbol, data_source="PharmGKB"):
    """
    遺伝子-薬物相互作用の照会。

    主要 PGx 遺伝子:
    - CYP2D6: コデイン, タモキシフェン, トラマドール
    - CYP2C19: クロピドグレル, エスシタロプラム, オメプラゾール
    - CYP2C9: ワルファリン, フェニトイン
    - CYP3A5: タクロリムス
    - DPYD: フルオロウラシル, カペシタビン
    - TPMT/NUDT15: アザチオプリン, 6-MP
    - UGT1A1: イリノテカン
    - SLCO1B1: シンバスタチン
    - HLA-B: アバカビル (*57:01), カルバマゼピン (*15:02)
    - VKORC1: ワルファリン
    """
    print(f"  Querying {data_source} for gene: {gene_symbol}")

    
    query_fields = {
        : gene_symbol,
        : ,
        : ,
        : ,
        : ,
        : ,
    }

     query_fields


 ():
    
    ()
     gene_symbol:
        ()
     drug_name:
        ()

     {: gene_symbol, : drug_name, : }