section-visualization

name	section-visualization
description	Generate comprehensive R data visualization tutorials (ggplot2, chart types, styling, publication-ready plots) with theory + practice workflow. Use when: (1) User requests visualization tutorials, (2) File names match 20xx-*.rmd pattern, (3) Keywords: boxplot, scatterplot, heatmap, forestplot, sankey, ggplot2 styling, color palettes.

核心任务

生成数据可视化类教程 (.rmd/.qmd)，涵盖图表原理、绘图代码、样式美化、结果解读。

快速启动 (Quick Start)

1. 确定图表: 如 "箱线图 (Boxplot)"。
2. 加载模板: 阅读 content-structure.md 获取 YAML 和标题结构。
3. 生成内容: 遵循 "图表用途 -> 数据准备 -> 绘图流程 -> 美化技巧 -> 解读说明" 流程。
4. 视觉设计: 参考 visual-templates.md 生成封面图和原理示意图。
5. 质量检查: 使用 quality-checklist.md 验证导航更新。

完整工作流程

步骤1: 逐部分生成教程内容（CRITICAL - 分段生成策略）

⚠️ 重要：教程内容超过 300 行时必须分段生成，避免一次性输出过长内容。

分段生成流程：

1. 第一部分：生成 YAML 头部 + Setup + 图表用途 + 数据准备 + 基础图表（约 150-200 行）
2. 第二部分：追加中级图表 + 美化技巧 + 主题定制（约 150-200 行）
3. 第三部分：追加高级应用 + 常见问题 + 相关资源（约 100-150 行）
4. 验证完整性：确认至少包含 3 个图表示例

内容生成要求：

• 必须包含: 至少 3 个图表示例（基础 → 中级 → 高级）
• 可复现性: 所有随机数据必须设置种子 set.seed(2026)

步骤1.5: 生成配图并在文章中引用（CRITICAL）

⚠️ 必须完成的两步操作：

第一步：生成图片文件

1. 封面图 (MANDATORY):

   • 路径：doc/images/[number]-[topic]-cover.svg
   • 风格：视觉吸引、展示图表类型

2. 文内示意图 (MANDATORY - 每篇至少 1 张)：

   • 路径：doc/images/diagrams/viz-*.svg
   • 格式：必须使用 SVG 格式（扩展名必须是 .svg）
   • 尺寸要求（CRITICAL）：
     • 推荐标准尺寸: viewBox="0 0 1400 800" (宽 1400, 高 800)
     • 对比表格图: 1400×800～1400×900 (横向宽幅)
     • 决策树: 1400×800 (横向布局，避免过高导致显示不全)
     • 配色方案展示: 1200×600～1400×700
     • 布局示意图: 1000×600～1200×700
     • ⚠️ 避免: 过高的纵向布局 (如 1000×1100)，会导致显示不全
   • 用途：图表类型对比、配色方案、布局结构
   • 示例场景：
     • 图表类型选择决策树
     • 常用配色方案展示
     • 布局排列示例
     • ggplot2 图层结构图
     • 图表对比表格

第二步：在文章中引用图片（CRITICAL）

⚠️ 生成图片后必须立即用 Markdown 语法在文章中引用！

## 图表类型选择指南

![常见图表类型选择决策树](images/diagrams/viz-chart-selection.svg)

**使用说明**：根据数据类型和展示目的，参考上图快速选择合适的图表。

插入位置：

• 配色方案图 → "配色方案"章节
• 图表选择树 → "图表用途"章节
• 布局示例 → "图形组合"章节

验证：

grep "!\[.*\](images/diagrams/" doc/[number]-[topic].rmd

步骤2: 验证渲染 (CRITICAL)

在提交前必须进行本地渲染验证，确保代码可运行且图片生成正确。

# 渲染单文件验证内容
quarto render doc/20[number]-[topic].rmd

# 确保图片生成在 doc/figure/ 目录下，无报错

步骤3: 更新导航系统 (CRITICAL)

⚠️ 重要顺序：必须先创建文章 → 更新 _quarto.yml → 运行 generate_sections.R

必须执行以下步骤，否则新文章无法在网站侧边栏和分类页显示。

⚠️ 更新导航前务必验证:

• 确认新文件已成功渲染
• 确认文件编号无冲突
• 确认YAML元数据正确

1. 更新 doc/_quarto.yml:

   • 找到 sidebar -> contents -> 数据可视化 部分。
   • 添加新条目，注意缩进:

               - text: "文章标题"
                 href: "20xx-filename.rmd"
     

2. 运行自动生成脚本 (MANDATORY - 在更新 _quarto.yml 之后):

   • ⚠️ 必须在 _quarto.yml 更新后运行，否则新的文章链接不会出现在 sections 中
   • 此脚本会根据 _quarto.yml 更新 sections/visualization.qmd 等分类索引页。

   # 在 doc 目录下运行
   cd doc && Rscript generate_sections.R
   

3. 渲染 sections 页面 (MANDATORY - 必须执行):

   ⚠️ 运行 generate_sections.R 后必须立即渲染 sections 页面！

   # 渲染 visualization 页面（新增文章所在分类）
   quarto render doc/sections/visualization.qmd
   
   # 如果需要，也渲染主页以更新导航
   quarto render doc/index.qmd
   

   为什么必须渲染：

   • generate_sections.R 只更新 .qmd 源文件
   • 必须渲染才能生成 HTML，新文章链接才会出现在网站侧边栏

4. 验证 sections 已更新:

   # 检查新文章是否出现在 sections/visualization.qmd 中
   grep "20xx-[filename]" doc/sections/visualization.qmd
   

步骤4: 最终渲染与提交

1. 重新渲染受影响页面:

   quarto render doc/sections/visualization.qmd
   quarto render doc/index.qmd
   

2. 提交代码:

   git add doc/20xx-*.rmd doc/images/[topic]-cover.svg
   git add doc/_quarto.yml doc/0001-guide.rmd README.md doc/sections/visualization.qmd
   git commit -m "feat(viz): 新增[图表类型]可视化教程"
   

写作规范

• 内容标准:
  • 详细度: 内容必须详尽，起到深入教程的作用。
  • 篇幅: 不少于 300 行 (Not less than 300 lines)。
  • 比例: 文字说明约占 70%，代码约占 30% (70% text, 30% code)。
  • 结构: 必须提前构建全面的内容框架，然后根据框架填充详细内容。
• 图文比例: 目标是每个代码块都有对应的图表输出。
• 配色: 优先使用 ggsci 期刊配色、ColorBrewer 或 viridis (色盲友好)。
• 注释: 每张图都要包含标题、坐标轴标签、图例标题。

参考资源

• content-structure.md: 详细内容模板与标题规范。
• visual-templates.md: SVG 封面与示意图模板库。
• quality-checklist.md: 完整质量检查与导航更新指南。
• color-palettes.md: 常用配色方案参考。