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生信知识库检索技能。覆盖生物信息学/R代码/机器学习/Python数据分析。 触发词：生信问题、R代码、DESeq2、ggplot2、差异表达、富集分析、 单细胞、转录组、基因组、pandas、tidyverse、clusterProfiler、 Seurat、dplyr、火山图、热图、PCA、GO、KEGG、GSEA、 RNA-seq、ChIP-seq、WGS、变异检测、进化树、机器学习、 随机森林、SVM、特征选择、降维、聚类、代码调试、报错
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| name | biorag |
| description | 生信知识库检索技能。覆盖生物信息学/R代码/机器学习/Python数据分析。 触发词：生信问题、R代码、DESeq2、ggplot2、差异表达、富集分析、 单细胞、转录组、基因组、pandas、tidyverse、clusterProfiler、 Seurat、dplyr、火山图、热图、PCA、GO、KEGG、GSEA、 RNA-seq、ChIP-seq、WGS、变异检测、进化树、机器学习、 随机森林、SVM、特征选择、降维、聚类、代码调试、报错 |
当用户的问题涉及以下领域时，必须先检索知识库再回答，不要跳过检索直接用自身知识：
检测到生信相关问题时，立即执行：
python "{SKILL_DIR}/scripts/search.py" "用户问题的核心关键词" --level 1
如果 Level 1 的结果不足以完整回答问题，执行：
python "{SKILL_DIR}/scripts/search.py" "更精确的查询词" --level 2 --category bioinfo
bioinfo / r_code / ml / other用户明确要求看完整内容，或 Level 2 仍不够时：
python "{SKILL_DIR}/scripts/search.py" "查询" --level 3 --full-doc
| category | 覆盖内容 | 适用场景 |
|---|---|---|
bioinfo | 生物信息学笔记、转录组、蛋白组、进化... | 原理/流程/概念问题 |
r_code | R 绘图模板、SCI 图表代码、Seurat... | R 代码生成/调试 |
ml | 机器学习笔记 | ML 相关问题 |
other | 其他所有内容 | 一般问题 |
| 不传 | 搜索全部分类 | 不确定分类时 |
（来源：DESeq2.md / 转录组学）用户说"知识库状态"或"检查知识库"时：
python "{SKILL_DIR}/scripts/status.py"
用户说"更新知识库"时：
python "{SKILL_DIR}/scripts/update.py"