| name | biologie-cellulaire-fondamentale |
| description | Compétence niveau ingénieur/docteur en biologie cellulaire. Couvre la membrane plasmique, les organites, le cytosquelette, le trafic vésiculaire et la matrice extracellulaire. |
| arxiv_categories | ["q-bio.CB","q-bio.SC"] |
Compétence : Biologie Cellulaire Fondamentale
Présentation
Compétence niveau ingénieur/docteur en biologie cellulaire : membrane plasmique, organites, cytosquelette, trafic vésiculaire, matrice extracellulaire, jonctions.
1. Membrane Plasmique
Structure bicouche
- Phospholipides : PC, PE, PS, PI, SM, cholestérol
- Asymétrie : feuillet externe (PC, SM, glycolipides) vs interne (PE, PS, PI)
- Fluidité : régulée par cholestérol, désaturases AG
- Radeaux lipidiques : domaines enrichis en SM + cholestérol
Protéines membranaires
- Intégrales : TM α-hélice, β-barillet, ancres GPI/lipides
- Périphériques : électrostatiques, protéine-lipide
- Transport : canaux, uniport, symport, antiport, pompes ATPases
Schéma
Glycoprotéines → Glycocalyx
Feuillet externe PC/SM/glycolipides
● Cholestérol
Feuillet interne PE/PS/PI
║ Protéines canal/transport
2. Organites
Noyau
- Enveloppe nucléaire (NE), pores NPC, lamina (lamines A/B/C)
- Import NLS (PKKKRKV) → importine → Ran-GTP
- Compartiments : nucléole (ARNr), speckles (épissage), Cajal bodies
RE (Réticulum Endoplasmique)
- RE rugueux : repliement, glycosylation N-liée, UPR (BiP, calnexine)
- RE lisse : lipides, Ca²⁺, détoxification (P450)
Golgi
- Cis → médian → trans : glycosylation, tri (M6P → lysosomes)
Lysosomes
- pH 5, V-ATPase, ~60 hydrolases (cathepsines, lipases)
- Autophagie : mTOR régule, autophagosome → lysosome
Mitochondries
- Double membrane, cristae, espace inter-membranaire, matrice
- ADNmt (16.6 kb), fission/fusion (Drp1, Mfn1/2, OPA1)
3. Cytosquelette
Microfilaments (actine)
- G-actine → F-actine (double hélice), extrémité + et -
- Profiline, cofiline, Arp2/3 (branchement), formine (nucléation)
- Myosines I, II, V, VI
Microtubules
- α/β-tubuline → protofilaments (13) → microtubule (25 nm)
- Instabilité dynamique, GTP-cap, catastrophe/sauvetage
- Kinésine (+), dynéine (-), MAPs (Tau, MAP2)
Filaments intermédiaires
- Kératines, vimentine, desmine, GFAP, neurofilaments, lamines
4. Trafic Vésiculaire
Vésicules
| Type | Manteau | Direction |
|---|
| COPII | Sar1, Sec23/24/13/31 | RE → Golgi |
| COPI | ARF1 | Golgi → RE |
| Clathrine | AP2, dynamine | TGN/PM → endosomes |
Fusion SNARE
v-SNARE (VAMP) + t-SNARE (syntaxine, SNAP-25) → complexe 4 hélices → fusion
Rab GTPases : marqueurs d'identité
5. Matrice Extracellulaire
| Composant | Rôle |
|---|
| Collagène (I-XXVIII) | Structure, force |
| Élastine | Fibres élastiques (cross-link lysyloxydase) |
| Protéoglycanes | GAGs + protéine core |
| Fibronectine (RGD) | Intégrines → adhésion |
Jonctions
- Serrees : claudines, occludines, ZO-1 → barrière
- Adhérentes : cadhérines → caténines → actine
- Desmosomes : cadhérines → filaments intermédiaires
- Gap : connexines → connexons (hexamères) → canaux
6. Références
- Alberts B. et al. — Molecular Biology of the Cell (7th ed.)
- Lodish H. et al. — Molecular Cell Biology (9th ed.)
- Pollard T.D. & Earnshaw W.C. — Cell Biology (3rd ed.)
- Rothman J.E. (1994) — Protein transport — Nature (Nobel 2013)