SyntaxSmith/nature-writing-skill

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SkillsMP 收录数据更新: 2026年11月9日 14:22

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# nature-writing-skill > Claude Code / Codex skill — 面向中国 AI / ML 研究者，主投 **Nature Machine Intelligence**、次投 **Nature Communications / Nature Computational Science**、必要时冲刺 **Nature** 的论文写作技能。把"能过审的 arXiv 风格"打磨成"Nature 系审稿人读完会说 *well-written, clearly motivated, compelling, careful, and hard to put down* 的论文"——本 skill 是 **44 篇开放获取论文逐句抽取**出来的 craft + taste + story-craft 手册，覆盖 abstract / intro / results / methods / discussion / figure 全链路。 --- ## 是什么 | 部分 | 文件 | 内容 | |---|---|---| | 写作 skill | `SKILL.md` | 骨架公式、写作顺序、按任务加载的 routing table、提交前 checklist、屏幕边 quick card、44 篇语料附录 | | 写作细节 | `references/01-story.md` … `15-taste-development.md` | 15 个主题文件，按需 Read | | 配图 skill | `FIGURE-SKILL.md` | Fig. 1 schematic 6 种构图、Wong/Okabe-Ito 8 色、字体字号、matplotlib/ggplot 模板、Illustrator 拼版流程 | | 配图细节 | `figure-references/01..12-*.md` | 12 个主题文件，按需 Read | | 语料 | `extracts/01-singlecell.md` … `07-ai-methods.md` | 7 类领域 / 44 篇 OA 论文的 verbatim 抽取，所有引文可 grep 回原文 | | 抽取方法 | `_framework.md` | 重建 / 扩充时参考 | ### 为什么"瘦索引 + 按需加载" 写作不是线性的。`SKILL.md` 只保留全局看得见的部分（骨架、顺序、checklist、quick card），其余 4000+ 行细节拆到 `references/`，按 routing 表只 Read 1–2 个文件——避免把整本手册塞进 context window。 | 你正在做什么 | Read | |---|---| | 写 abstract | `references/03-abstract.md` | | 写 Results 子节 | `references/05-results.md` + `FIGURE-SKILL.md` | | 自审稿 | `references/09-reviewer-protocol.md` + `references/13-antipatterns.md` | | 选投哪个刊 | `references/14-journals.md` | | 卡在一句话上 | `references/08-sentence-taste.md` | | 长期 taste 培养 | `references/15-taste-development.md` | 完整 routing 表见 [`SKILL.md`](./SKILL.md) §1。 --- ## 安装 ### Claude Code ```bash # 用户级（所有项目都能用） git clone https://github.com/SyntaxSmith/nature-writing-skill.git ~/.claude/skills/nature-writing # 或项目级（仅当前项目） git clone https://github.com/SyntaxSmith/nature-writing-skill.git .claude/skills/nature-writing ``` Claude Code 启动后会自动读取 `SKILL.md` 的 frontmatter。在对话里输入 `/nature-writing` 触发，或直接自然语言："用 nature-writing skill 帮我打磨这段 abstract"。 ### Codex CLI Codex 没有 skill 概念，把仓库 clone 到任意位置，然后在项目 `AGENTS.md` 里加指针： ```bash git clone https://github.com/SyntaxSmith/nature-writing-skill.git ~/skills/nature-writing ``` ```markdown  ## Writing for Nature-family journals When drafting or revising papers for NMI / NC / NCS / Nature, first read `~/skills/nature-writing/SKILL.md`, then load only the relevant `references/*.md` per the routing table in §1.1. ``` 或临时把对应章节作为附件丢给 Codex： ```bash codex "@~/skills/nature-writing/references/03-abstract.md 用这一节检查我的 abstract" ``` ### 其他 agent / chatbot `SKILL.md` 是纯 Markdown，没有专属语法。任何能读文件的 LLM 工具（Cursor、Continue、Aider、ChatGPT custom GPT、Gemini Code Assist……）都可以把它当 system prompt 或附件用。 --- ## 用法示例 **写 abstract** ``` > 我有一段 ML 方法论文的 abstract，请用 nature-writing skill 检查 pivot、 KEY-RESULT 是否有 named baseline、outlook 动词是否与证据强度匹配。 [paste abstract] ``` **自审稿（5-pass harsh referee）** ``` > 用 references/09-reviewer-protocol.md 的 SNEER / NOD / ASK / CUT 协议审一遍我的 Results 章节，每段给 invisible answer。 ``` **提交前总扫** ``` > 跑一遍 SKILL.md §2 的 checklist，每条标 ✅ / ⚠️ / ❌， ⚠️ 和 ❌ 给具体修改建议。 ``` **子门类剧本** ``` > 这是一篇 LLM-agent 论文，按 references/12-subgenres.md 的剧本检查： prompt 报告完整性、tool schema 在不在 SI、外部 API 版本和 date 有没有写。 ``` --- ## 目录结构 ``` . ├── SKILL.md # 写作 skill 瘦索引（必读） ├── FIGURE-SKILL.md # 配图 skill 瘦索引 ├── _framework.md # 抽取方法论 ├── references/ # 15 个写作细节文件 │ ├── 01-story.md # 7 种 canonical story shapes、Fig. 1 四种功能 │ ├── 02-title.md # Title 6 种定式 │ ├── 03-abstract.md # 5–8 句句式图、Two-gap、carve-out │ ├── 04-intro.md # 漏斗 4–6 段、6 种 hook、GAP 词库 │ ├── 05-results.md # 标题三风格、figure call-out、统计写法、ablation │ ├── 06-methods.md # 复现性三处呼应、LLM-agent 专用清单 │ ├── 07-discussion.md # Outlook 动词等级、Limitation as boundary │ ├── 08-sentence-taste.md # rhythm、经济、restraint、negative space │ ├── 09-reviewer-protocol.md │ ├── 10-voice.md # DeepMind / NMI / NC / NCS / 临床 5 种 voice │ ├── 11-language-bank.md # 强动词 / hedge / 段间连接 │ ├── 12-subgenres.md # 7 个子门类剧本 │ ├── 13-antipatterns.md │ ├── 14-journals.md # 各刊 voice 与策略 │ └── 15-taste-development.md ├── figure-references/ # 12 个配图细节文件 ├── extracts/ # 7 个语料文件 / 44 篇 OA 论文 verbatim └── archive/SKILL.v3.md # 上一代 craft-only 版（保留供参考） ``` --- ## 语料来源（44 篇 OA 论文） | # | 领域 | 论文 | 刊物 | |---|---|---|---| | 1–6 | 单细胞基因组 | Geneformer · SCimilarity · Tangram · scIB · CellOracle · CellFM | Nature × 3 / Nat Methods × 2 / NC | | 7–12 | 蛋白 / 结构 AI | AlphaFold2 · ESM-2 · ProteinMPNN · RFdiffusion · AlphaMissense · Foldseek | Nature × 2 / Science × 3 / Nat Biotechnol | | 13–18 | 物理 / 气候 / 材料 | GraphCast · GenCast · DIMON · M3GNet · HINTS · GNoME | Science / Nature × 2 / NCS × 2 / NMI | | 19–24 | 药物发现 | DynamicBind · Wong-MRSA · Halicin · SyntheMol · RetroExplainer · DRAGONFLY | NC × 4 / Nature / Cell | | 25–30 | 临床 AI | MedSAM · UNI · CONCH · Virchow · MedPerf · Ferber-GPT4V | Nat Med × 3 / NC × 2 / NMI | | 31–36 | ML 通用 / 基础模型 | ChemCrow · AlphaGeometry · MolE · SemanticLens · Cancer-Imaging-FM · FunSearch | NMI × 4 / Nature × 2 / NC | | 37–44 | 纯 AI 方法 (v5 新增) | DeepSeek-R1 · Densing-law · AligNet · ADeLe · Webb-MAP · DiscoRL · Farquhar-semantic-entropy · Whitelam-Simmering | Nature × 5 / NMI / NC × 2 | 所有引文均来自开放获取论文（CC-BY 等 license），用于学术评论 / 写作教学。原作者保留版权。 --- ## 如何扩展新增第 8 类领域 / 第 45 篇论文： 1. 用 [`_framework.md`](./_framework.md) 的抽取格式，在 `extracts/` 下加新文件。 2. 把新句式 / 新模板回灌到对应 `references/*.md`（不是 `SKILL.md`，后者保持瘦索引）。 3. 更新 `SKILL.md` 附录 A 的 corpus 表 + `references/README.md` 的目录。 --- ## License - **代码 / Markdown 结构 / 抽取框架**：MIT - **verbatim 引文**：原作者保留版权，使用时遵守对应 OA license。本仓库属于学术评论 / 教学用途。 --- ## Patron sentence > "Many problems in mathematical sciences are *easy to evaluate*, despite being typically *hard to solve*." > — FunSearch (Romera-Paredes et al., *Nature* 2024) 写论文这件事正相反：易写难精。这把 skill 的目标，是让写得"对"和写得"好"之间的 gap 缩短一些。

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高校计算机科学教师

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高校计算机科学教师

面向中国 AI / ML 研究者，主投 Nature Machine Intelligence、次投 Nature Communications / Nature Computational Science、必要时冲刺 Nature 的论文写作技能（craft + taste + story-craft）。v5 在 v4 拆分版上吸收了 8 篇 2024–2026 NMI/NC/Nature 纯 AI 方法论文（DeepSeek-R1、Densing…

2026-04-27

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