القائمة
Generate marker gene heatmaps with hierarchical clustering dendrograms.
يُحدَّد Prompt الذي يراجع المصدر أولًا بشكل افتراضي. يمكنك التبديل إلى أمر مباشر أو تنزيل نسخة محلية.
اقرأ SKILL.md وأي ملفات مرافقة يعرضها SkillsMP قبل أن تقرر التثبيت.
التثبيت باستخدام Codex أو Claude انسخ هذا Prompt والصقه في Codex أو Claude أو مساعد آخر ليراجع صفحة Skill ويثبّتها لك.
يتجاوز الأمر المباشر Prompt المخصّص للمراجعة. افحص المصدر قبل تشغيله.
npx skills add https://github.com/BrainStOrmics/BIA-CellHashtag --skill plotting-heatmapsيبقى الأمر في سطر واحد. مرّر أفقيًا لمراجعته كاملًا قبل النسخ.
تفضّل نسخة محلية؟ نزّل الملفات المتاحة حاليًا لدى SkillsMP.
Correct batch effects in single-cell data using Harmony, BBKNN, or ComBat.
استنادا إلى تصنيف SOC المهني
عرض SKILL.md
| name | plotting-heatmaps |
| description | Generate marker gene heatmaps with hierarchical clustering dendrograms. |
| allowed-tools | Read, Bash |
| compatibility | scRNA-seq, snRNA-seq |
To visualize marker gene expression patterns across clusters for annotation review.
heatmap(adata, genes, groupby, output_dir=None, dendrogram=True, show_values=False) -> strCreates marker gene heatmap with optional dendrogram.
Saves to {output_dir}/heatmap_{groupby}.png