EpiAgentKit

初始化标准卫生统计研究或咨询项目，默认生成 R 七层目录，也可按用户明确选择生成 Python 目录，并创建 PROTOCOL、SAP、结果单源、registry 与可选 Git 配置。仅在用户明确要求创建项目或把空工作区建成正式项目时使用；简单作业、快速核验和已有项目分析不触发。上游为 biostat-principles；咨询项目完成分析后再用 consulting-delivery。

Python 流行病学与生物统计分析的可选执行层，仅用于用户明确要求 Python，或既有项目已经以 Python 为主流程时的数据清洗、描述统计、回归、生存分析、预测验证、统计表图、代码调试和结果复现。开工先遵循 biostat-principles；统计图配合 publication-figures，客户外发再用 consulting-delivery。未指定语言的普通统计分析、R 环境或依赖缺失、研究设计定稿、论文写作或仅操作 xlsx 文件不触发。

R 流行病学与生物统计的主要执行层，用于 R 数据清洗、描述统计、回归、生存、中介、Meta 分析、统计表图和代码调试；用户未指定语言且无既有语言合同时也使用。开工先遵循 biostat-principles；统计图配合 publication-figures，客户外发再用 consulting-delivery。不用于已明确采用 Python 的分析、研究设计定稿或论文写作。

基于已验证的代码、结果单源和表图生成或结构性重写中英文期刊论文、学位论文部件、摘要、题名、cover letter、审稿回复、highlights 和投稿正式往来，并做投稿前一致性自查。开工先用 biostat-principles，终审用 academic-humanizer；实际 Word 操作再配合 docx。已有文本的局部润色或压缩只用 academic-humanizer。

流行病学与生物统计的上游行为原则，用于研究设计、R/Python 分析、论文、咨询交付和项目审查开工前，以及口径争议、结果不一致或试新方法时。提供原始数据只读、最小实现、可验证目标、结果追溯、复现、异常闭环和隔离实验规则；轻量任务不因此升级为正式项目。

把已完成并验证的 R 或 Python 分析打包为客户可独立复现、可直接阅读且保留真实溯源的咨询交付物。用于“给客户交付”“打包结果”或在 05_reports/ 建正式结果包；不用于未完成分析或内部探索。上游为 biostat-principles，文本终审配合 academic-humanizer，签发配合 epi-project-audit。

科研决策的证据检索、来源身份核验、证据评价与适用性判断技能。触发场景：(1) 快速核验单个事实、单篇引文、标题、DOI 或 PMID；(2) 查找最新证据、指南、方法依据或真实引文；(3) 构建结局指标、选择量表、制定异常值规则；(4) 试新方法、比较指标或判断跨领域方法能否迁移。 自动选择 rapid verification 或 formal evidence review。两种模式均核验来源身份；只有 formal 模式强制完整检索协议和证据矩阵。不负责统计模型实跑或论文正文生成，不得以文献替代项目数据核验，不得编造来源或研究结论。

为 R 或 Python 真实数据选择、绘制、返工和审查发表级统计图、数据图，包括森林图、生存曲线、ROC、热图和模型诊断，并控制尺寸、字体、配色与多面板。任何 ggplot/matplotlib 统计出图均使用；流程、机制、框架和技术路线转 research-visuals。上游为 biostat-principles。

把分析结果、进展、流程或操作要求写成结论先行、数据有源、面向行动的中文报告、指南、备忘或纪要。只要正文时不调用 docx；实际生成 Word 时再配合 docx。不用于论文与投稿材料（academic-publishing）或咨询交付包打包（consulting-delivery）。

Operate actual Word .docx files: create, read, edit, render, validate, convert, or handle layout, images, comments and tracked changes. Use the relevant paper or report content skill first, then add docx only when a Word file is an input or deliverable. Do not use for prose-only requests, PDFs, spreadsheets or Google Docs.

六层审查流行病学与生物统计项目的数据链、代码、结果、表图、正文和交付一致性，并以证据判定是否可签发。用于项目质控、结果复核、审稿前自查或全面一致性检查；只审查时不修改文件。上游为 biostat-principles，含咨询包时同时核对 consulting-delivery。

流行病学研究设计与统计分析计划工作流。用于把研究想法转成可执行的 PICO/PECO、目标人群、estimand、终点、纳排、偏倚控制、样本量或精度依据、PROTOCOL 和 SAP，或审查既有方案。开工先对齐 biostat-principles；需要方法、指标或报告规范依据时调用 evidence-research。不用于创建项目目录、运行统计模型、撰写结果或论文正文。

回归安全地维护 EpiAgentKit 的 CLAUDE/AGENTS 规则、skills、references、hooks、安装同步、doctor、路由、合同测试和 README。用于完善、重构、排查或审查这些仓库组件；普通研究项目的数据分析、写作或项目初始化不触发本 skill。修改 skill 时同时使用 skill-creator；Git 仅在已可用且当前目录为仓库时使用。

Create or execute reviewable Conventional Commits from the complete diff, validation evidence and compatibility impact. Use for commit messages, staged-change review, commits, explicit push requests or repository-history cleanup. Only run when Git exists and the current directory is already a repository; never install Git or initialize one for this skill.

Read, extract, create, merge, split, rotate, watermark, OCR, secure, validate or fill actual PDF files. Use whenever a PDF is a primary input or requested output; do not replace the relevant writing or analysis content workflow.

Operate actual .pptx files: create, read, edit, render, validate, combine, split, or handle templates, layouts, notes and comments. Use the relevant presentation content workflow such as sysu-ppt first, then add pptx only when a presentation file is an input or deliverable. Do not trigger for discussion of a talk without file work.

以 imagegen 为默认路径生成或重绘科研、医学和公共卫生的跨载体非统计视觉，包括流程、路线、结构、框架、机制、时间线、图形摘要、封面、README 和网页内容图。先区分内容图、真实截图与氛围图；统计数据图转 publication-figures，科研原始图像不得生成式重绘，现有 UI 优先复用，仅按明确回退条件转 svg-diagrams。

Create or update an effective agent skill with clear routing, concise progressive disclosure, reusable resources and regression-safe validation. Use whenever a user asks to add, revise, optimize or package a skill.

创建、审校或修改可编辑且内容精确的 SVG 非统计图解。仅在用户明确要求 SVG/矢量源、编辑现有 SVG，或 research-visuals 已实际耗尽适用 imagegen 路径且仍无法保证文字和关系准确时使用。HTTP 524、文字密集或预测生成会失败均不是回退凭证；普通非统计视觉先走 research-visuals，统计图走 publication-figures。

基于 officer 与中山大学官方模板制作组会、开题、中期、答辩或正式学术汇报 PPT。用户要求中大学术演示文件或新汇报文件夹时使用；页数与结构服从时长、内容和证据，组会禁止目录页及章节分隔页。实际文件操作配合 pptx。

Read, clean, create, edit, format, chart, validate or convert spreadsheet files (.xlsx, .xlsm, .csv, .tsv) when a spreadsheet is the primary input or deliverable. Do not trigger when the deliverable is primarily a document, report, standalone script, database pipeline or Google Sheets integration.

中英文学术文本的证据约束编辑与审校技能。用于论文、学位论文、摘要、基金申请书、cover letter、 response to reviewers、rebuttal、编辑部往来和科研邮件的润色、改写、压缩或语气校准。先锁定事实、 数字、统计方向、引文、公式和图表指向，再去除模板化表达、调整论断强度、匹配作者声纹与目标期刊或 资助机构语体。不得生成研究发现，不得改动数据或引文，不用于规避披露要求。

通用 Python 心电图（ECG）分析技能，覆盖 ECG 预处理与波形质量控制、心拍/心率变异性（HRV）/表征特征、纵向或多轮 ECG 对齐、超声或临床结局连接及患者级建模。 触发场景：(1) 用 Python 处理 ECG 原始信号；(2) 做心拍、HRV、波形或表征特征；(3) 对齐同一患者多轮 ECG；(4) 连接 ECG 与超声/临床结局；(5) 构建患者级 ECG 模型。 不适用：普通 R 生物统计任务、非 ECG 的通用机器学习、仅写论文或报告。项目命令、参数和数据位置必须从项目规则、README、代码与实际 --help 读取，不得写死。 上游依赖：开工前对齐 biostat-principles；实际生成统计图时使用 publication-figures。