القائمة
Use when converting GenBank flatfiles into XML for downstream EDirect or XML-based sequence annotation workflows.
يُحدَّد Prompt الذي يراجع المصدر أولًا بشكل افتراضي. يمكنك التبديل إلى أمر مباشر أو تنزيل نسخة محلية.
اقرأ SKILL.md وأي ملفات مرافقة يعرضها SkillsMP قبل أن تقرر التثبيت.
التثبيت باستخدام Codex أو Claude انسخ هذا Prompt والصقه في Codex أو Claude أو مساعد آخر ليراجع صفحة Skill ويثبّتها لك.
يتجاوز الأمر المباشر Prompt المخصّص للمراجعة. افحص المصدر قبل تشغيله.
npx skills add https://github.com/vimalinx/bio-agent --skill gbf2xmlيبقى الأمر في سطر واحد. مرّر أفقيًا لمراجعته كاملًا قبل النسخ.
تفضّل نسخة محلية؟ نزّل الملفات المتاحة حاليًا لدى SkillsMP.
Use when joint-genotyping one or more germline gVCFs into a cohort VCF with GATK GenotypeGVCFs.
Use when running GATK HaplotypeCaller to emit per-sample germline variant calls or gVCFs from analysis-ready BAM/CRAM inputs.
Use when splitting mixed accession-like text into one lowercase token per line in EDirect-style text pipelines.
استنادا إلى تصنيف SOC المهني
عرض SKILL.md
| name | gbf2xml |
| description | Use when converting GenBank flatfiles into XML for downstream EDirect or XML-based sequence annotation workflows. |
| disable-model-invocation | true |
| user-invocable | true |
gbf2xml < records.gbf > records.xml/home/vimalinx/miniforge3/envs/bio/bin/gbf2xml# 1) Convert a GenBank flatfile into XML
gbf2xml < records.gbf > records.xml
# 2) Convert and inspect the resulting XML structure quickly
gbf2xml < records.gbf | sed -n '1,40p'
gbf2xml through stdin redirection or a pipe.xtract or other downstream tools only after that smoke test passes.transmute -g2x, so the companion transmute binary must be on PATH.--help / --version interface.