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对某个理论、方法或主题分类下的 Zotero 精读 notes 生成分类脉络综述；默认使用 Obsidian 双链交叉引用，方便从综述跳转到单篇论文笔记。
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استنادا إلى تصنيف SOC المهني
基于新版精读 notes 生成理论、方法、主题候选分类与人工审核队列；也可生成 Zotero 写回 dry-run 计划，但第一版不真实写回 Zotero。
根据新版精读笔记回答问题。只使用 notes\\zotero_reading 下的有效笔记，不扫描旧 note，不回到 Zotero 原库重新阅读。
单次问答技能。根据新版精读笔记定位证据并回答用户问题。
检查 Zotero 索引、精读 notes、分类属性、Publication Tag 与 Obsidian Bases 视图之间的同步状态；生成健康报告、属性补齐 dry-run、期刊等级同步和位置整理。
收到“更新索引”或“请精读 Zotero 中 xxx”时使用。先刷新本地索引，再由 Python 精读流水线优先读取 Zotero 的全文缓存（.zotero-ft-cache），必要时才回退 PDF，并结合外部 embedding / LLM 生成结构化精读笔记。
收到“更新索引”时使用。查询 Zotero，生成支持 AI 精读流水线的本地索引，重点强化分组、PDF 路径、附件 key 和全文缓存路径。
| name | theory-method-synthesis-system |
| description | 对某个理论、方法或主题分类下的 Zotero 精读 notes 生成分类脉络综述；默认使用 Obsidian 双链交叉引用，方便从综述跳转到单篇论文笔记。 |
用户可以直接这样说：
请基于已生成的新版 notes，为“金融传染”生成一份理论综述。只使用 notes 中已有证据，不重读 PDF，不写回 Zotero。完成后告诉我综述文件路径、引用了哪些笔记、哪些地方证据不足。
方法或主题也可以这样说：
请为“DCC-GARCH”生成方法综述，重点整理它服务哪些研究主题、常见变量和主要发现。
Codex 应该把综述当成 Obsidian 入口和研究整理草稿，不应把它包装成可直接发表的论文文本。
${MINDCITE_ROOT}\notes\zotero_reading\_papers 中的现有精读笔记。${MINDCITE_ROOT}\indexes\classification_taxonomy.json 判断标签维度、父级、子级和组合模型关系。运行：
python ${MINDCITE_ROOT}\_skills\Theory-Method-Synthesis-System\scripts\build_classification_synthesis.py --label <分类名>
默认输出按标签架构分层，不再使用 classification_synthesis_ 前缀：
${MINDCITE_ROOT}\notes\classification_synthesis\理论\<父级理论>\<分类名>.md${MINDCITE_ROOT}\notes\classification_synthesis\方法\组合模型\<父级组合>\<分类名>.md${MINDCITE_ROOT}\notes\classification_synthesis\主题\<父级主题>\<分类名>.md${MINDCITE_ROOT}\notes\classification_synthesis\分类综述入口.md[[笔记文件名|论文题名]] 链接，保证能从综述跳转到原始精读笔记。[[文献总览|文献总览]]、[[理论方法主题|理论方法主题视图]]、[[高质量期刊|高质量期刊视图]] 这类链接。# 金融传染，不带脚本前缀。核心文献入口 放在前部，并尽量抽取单篇笔记正文中的完整“研究结论/核心发现”段落。全部匹配文献 前面，避免开头太重。