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收到“更新索引”时使用。查询 Zotero，生成支持 AI 精读流水线的本地索引，重点强化分组、PDF 路径、附件 key 和全文缓存路径。
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استنادا إلى تصنيف SOC المهني
对某个理论、方法或主题分类下的 Zotero 精读 notes 生成分类脉络综述；默认使用 Obsidian 双链交叉引用，方便从综述跳转到单篇论文笔记。
基于新版精读 notes 生成理论、方法、主题候选分类与人工审核队列；也可生成 Zotero 写回 dry-run 计划，但第一版不真实写回 Zotero。
根据新版精读笔记回答问题。只使用 notes\\zotero_reading 下的有效笔记，不扫描旧 note，不回到 Zotero 原库重新阅读。
单次问答技能。根据新版精读笔记定位证据并回答用户问题。
检查 Zotero 索引、精读 notes、分类属性、Publication Tag 与 Obsidian Bases 视图之间的同步状态；生成健康报告、属性补齐 dry-run、期刊等级同步和位置整理。
收到“更新索引”或“请精读 Zotero 中 xxx”时使用。先刷新本地索引，再由 Python 精读流水线优先读取 Zotero 的全文缓存（.zotero-ft-cache），必要时才回退 PDF，并结合外部 embedding / LLM 生成结构化精读笔记。
| name | zotero-index-updater |
| description | 收到“更新索引”时使用。查询 Zotero，生成支持 AI 精读流水线的本地索引，重点强化分组、PDF 路径、附件 key 和全文缓存路径。 |
请只读更新我的 Zotero 索引。完成后用自然语言告诉我：索引了多少篇文献、多少个 Zotero 分类、多少条缺 PDF、多少条进入 fallback 待分类，以及索引报告在哪里。
Codex 应该自动运行索引脚本并解释输出，不要求用户理解 jsonl 或 SQLite。
刷新出一套能直接喂给 Python 精读流水线的索引文件，而不只是给人工搜索用。
attachment_keyspdf_pathsprimary_pdf_pathfulltext_cache_pathsprimary_fulltext_cache_pathhas_fulltext_cachezotero_select_urizotero_open_pdf_uri${MINDCITE_ROOT}\indexes\zotero_library_index.jsonl${MINDCITE_ROOT}\indexes\zotero_collection_tree.json${MINDCITE_ROOT}\indexes\zotero_index_summary.md${MINDCITE_ROOT}\indexes\zotero_index_meta.json${MINDCITE_ROOT}\notes\zotero_readingitem_key 定位现有 note，并写入 active_note_pathlogs\update_index_*.mditem_keytitleitem_typeyeardoicollection_pathsprimary_collection_pathattachment_keyspdf_pathsprimary_pdf_pathhas_pdffulltext_cache_pathsprimary_fulltext_cache_pathhas_fulltext_cachereading_statusactive_note_pathupdated_at