external-term-lookup

Use this to search for relevant terms in external ontologies. NEVER guess ontology terms or term IDs, always confirm using this skill. The general methodology is to use `obo-grep.pl`

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Repository: geneontology/go-ontology
Letzte Quellaktivität: 31. März 2026 um 03:30
Erkannte Sprache von SKILL.md: Englisch
Sterne: 251
Forks: 48

Installationsoptionen

Standardmäßig ist der Prompt ausgewählt, der zuerst die Quelle prüft. Sie können zu einem direkten Befehl wechseln oder eine lokale Kopie herunterladen.

Mit Codex oder Claude installieren Kopieren Sie diesen Prompt, fügen Sie ihn in Codex, Claude oder einen anderen Assistant ein und lassen Sie die Skill-Seite prüfen und installieren.

Ein direkter Befehl überspringt den Prüf-Prompt. Prüfen Sie die Quelle, bevor Sie ihn ausführen.

npx skills add https://github.com/geneontology/go-ontology --skill external-term-lookup

Der Befehl bleibt in einer Zeile. Scrollen Sie horizontal, um ihn vor dem Kopieren vollständig zu prüfen.

Sie bevorzugen eine lokale Kopie? Laden Sie die Dateien herunter, die SkillsMP derzeit vorliegen.

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Lesen Sie SKILL.md und alle von SkillsMP angezeigten Begleitdateien, bevor Sie sich für eine Installation entscheiden.

SKILL.md

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odk-make

Use whenever you run a Makefile target (e.g. `make travis_build`, `make test`, `make reasoned.ofn`) or any one-off ROBOT / owltools / dosdp-tools / scala-cli command derived from a Makefile recipe. These must run inside the pinned ODK Docker image, not against host tools. Covers validation, reasoning, imports, and release builds in src/ontology.

2026-08-25

souffle-datalog

For reading, writing, debugging, or extending Soufflé Datalog (`.dl`) programs in this repo — the layered ontology QC program under `src/util/qc/`, the `basic-cycles.tsv` cycle check, taxon-constraint materialization, and the relation-diff CI report. Covers the RDF fact-file format these programs consume, this repo's Soufflé conventions, the check registry, and the required control-ontology self-test for any new or changed rule.

2026-08-24

pr-review

For reviewing a pull request against the GO ontology, whether from a local checkout or from the automated reviewer in CI. Covers what to check, how to grade severity, and how to report coverage honestly. Use whenever asked to review, critique, or check a PR or a diff to go-edit.obo.

2026-07-27

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