| name | qinyan-nature-statistics |
| description | 面向 Nature Portfolio 与高影响力期刊的实验设计一致型统计分析、审查和报告技能。用于定义独立实验单位与重复层级、制定统计分析计划、检查数据质量、选择模型与估计量、计算效应量和不确定性、处理多重比较与敏感性分析，并重写 Methods、Results、表格和图注中的统计文本。触发场景包括 Nature 统计、数据统计、statistical analysis、p value、sample size、effect size、confidence interval、replicates、multiple comparisons、统计方法、图注统计和审稿人统计意见。 |
沁言 Nature 统计分析与报告
从研究设计和估计目标出发，再选择模型和检验。统计显著性不能替代效应大小、数据质量或科学意义。
工作模式
plan：在分析前定义问题、实验单位、主要终点、模型、校正与敏感性分析。analyse：用户提供数据后执行可复现分析，并保留数据处理与诊断记录。audit：审查现有统计方法、结果、表格与图注。rewrite：在事实充分时生成可粘贴的统计方法或结果文本。review-response：解析审稿人统计问题，给出验证路径与保守回复要点。
复杂临床试验、监管分析或患者级决策必须服从协议、统计分析计划和专业统计师审核。
必须先回答的设计问题
- 科学问题和主要 estimand 是什么？
- 独立实验单位是什么，
n 如何定义？
- 生物重复、技术重复、子样本、批次和重复测量如何嵌套？
- 主要与次要终点、组别、时间点和协变量是什么？
- 分配、随机化、盲法、纳排、缺失和异常如何处理？
- 哪些比较是预设，哪些是探索性？
这些事实不清时，不给出最终检验选择；使用 AUTHOR_INPUT_NEEDED。
执行流程
- 建立设计图。 画出实验单位、层级、配对、重复测量、批次与时间结构。
- 定义 estimand。 指明要估计的差异、比值、斜率、关联、预测性能或时间效应及其目标人群。
- 审计数据。 记录数据类型、单位、缺失、范围、重复、异常、排除和变换；保留前后计数。
- 选择分析策略。 根据设计、分布、样本量和 estimand 选择模型，不仅依赖正态性检验。读取 references/analysis-plan.md。
- 执行与诊断。 报告模型假设、残差/拟合诊断、收敛、影响点、多重比较和敏感性分析。
- 解释效应。 优先给出效应量、置信区间和实际意义，再报告精确 p 值。
- 对齐图表。 确保图中数据层级、误差、星号、图注和正文与分析完全一致。读取 references/reporting-and-figures.md。
- 运行报告审计。 对统计文本执行
python scripts/reporting_audit.py <file> --context methods|results|legend。
- 交付复现信息。 提供分析代码、软件版本、随机种子、数据字典、处理日志和未解决风险。
实验单位、伪重复和常见故障读取 references/design-integrity.md。
默认输出
Statistical scope
- Mode / input / boundary:
- Scientific question and estimand:
- Independent unit and n:
- Design hierarchy:
Analysis specification
- Outcome / predictors / contrasts:
- Model or test:
- Assumptions and diagnostics:
- Multiplicity:
- Sensitivity analyses:
Results
- Effect estimate and uncertainty:
- Exact inferential result:
- Practical interpretation:
Ready-to-paste reporting
[Methods / Results / legend]
AUTHOR_INPUT_NEEDED
- [事实性缺口]
Reviewer-risk note
- [剩余风险]
红线
- 不虚构样本量、p 值、自由度、区间、功效、软件版本、排除、随机化或盲法。
- 不把细胞、视野、技术读数、模拟运行或同一个体的多次测量默认为独立
n。
- 不用“显著”表示重要、巨大、因果或生物学相关。
- 不因 p > 0.05 宣称“无差异”或“等效”，除非设计支持相应推断。
- 不用组内显著/不显著差异推断组间交互。
- 不通过删除数据、改变终点或尝试多个模型后只报告最佳结果来追求显著性。
- 不把探索性分析包装成预设确认性分析。
资料路由
| 任务 | 读取 |
|---|
| 实验单位、嵌套、重复测量、伪重复、缺失与排除 | references/design-integrity.md |
| estimand、模型选择、诊断、效应量、多重比较与敏感性 | references/analysis-plan.md |
| Methods、Results、表格、图注和统计图形报告 | references/reporting-and-figures.md |
