nextflow-development
Run nf-core bioinformatics pipelines (rnaseq, sarek, atacseq) on sequencing data. Use when analyzing RNA-seq, WGS/WES, or ATAC-seq data—either local FASTQs or public datasets from GEO/SRA. Triggers on nf-core, Nextflow, FASTQ analysis, variant calling, gene expression, differential expression, GEO reanalysis, GSE/GSM/SRR accessions, or samplesheet creation. Use when this capability is needed.
Quellinformationen
- Repository
- tomevault-io/copilot-plugins
- Letzte Quellaktivität
- 8. April 2026 um 12:03
- Erkannte Sprache von SKILL.md
- Englisch
- Sterne
- 4
- Forks
- 1
Installationsoptionen
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Quellanweisungen · Schreibgeschützte Vorschau| name | nextflow-development |
|---|---|
| description | Run nf-core bioinformatics pipelines (rnaseq, sarek, atacseq) on sequencing data. Use when analyzing RNA-seq, WGS/WES, or ATAC-seq data—either local FASTQs or public datasets from GEO/SRA. Triggers on nf-core, Nextflow, FASTQ analysis, variant calling, gene expression, differential expression, GEO reanalysis, GSE/GSM/SRR accessions, or samplesheet creation. Use when this capability is needed. |
