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Migrate a Nextflow pipeline to new language patterns.
原文の言語: 英語
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nextflow-io/agent-skills
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このリポジトリの skills
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skill
職業分類
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職業分類
未分類
説明
INVOKE THIS SKILL IMMEDIATELY when user asks to: write/create/build a Nextflow pipeline or workflow, create any bioinformatics pipeline (RNA-seq, DNA-seq, variant calling, ChIP-seq, etc.), or compose/chain Nextflow modules (process or workflow modules) from…
原文の言語: 英語
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職業分類
未分類
説明
Install or upgrade Nextflow on the user's machine. Use when the user wants to install Nextflow, check their current Nextflow version, upgrade Nextflow, or set up the prerequisites (Java 17+) needed to run Nextflow.
原文の言語: 英語
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職業分類
未分類
説明
Run Nextflow Registry modules natively using `nextflow module` commands. Use when running, listing, or getting info about Nextflow modules, including process modules (a single tool) and workflow modules (subworkflows that chain several modules).
原文の言語: 英語
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職業分類
ネットワーク・コンピュータシステム管理者
説明
Launch Nextflow pipeline executions on cloud and HPC clusters via Seqera Platform. Use when the user wants to run/launch/submit a pipeline on a cloud or cluster compute environment, configure a compute environment, push pipeline changes to GitHub before…
原文の言語: 英語
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