| name | MCP BioMCP |
| description | 生物信息学工具，整合基因查询、NCBI搜索、蛋白质分析、临床试验等功能。整合PubMed、ClinicalTrials.gov、MyGene.info、NCBI等权威数据源。当用户需要查询基因信息、搜索NCBI、蛋白质信息、生物文献时使用此技能。 |
| triggers | ["基因","NCBI","蛋白质","生物信息","PubMed","临床实验","基因变异"] |
| mcp | {"command":"uvx","args":["--with","biomcp-python","biomcp","serve"]} |
BioMCP 生物信息学技能（整合版）
整合 BioMCP + NCBI 基因搜索，一站式生物信息学服务。
🧬 核心功能
基因信息查询
- NCBI Gene：基因详情、序列信息、基因组位置
- MyGene.info：基因批量查询、注释信息
- UniProt：蛋白质序列、结构、功能
变异分析
- ClinVar：致病性变异、临床意义
- gnomAD：变异频率、人群分布
- 疾病关联：疾病-基因关系
文献检索
- PubMed：生物医学文献搜索
- 文献关联：基因相关文献
临床试验
- ClinicalTrials.gov：临床试验查询
- 疾病相关试验：按疾病/基因筛选
🔧 工具对比
| 功能 | BioMCP | NCBI搜索 |
|---|
| 基因查询 | ✅ MyGene.info | ✅ NCBI Gene |
| 蛋白质 | ✅ UniProt | ✅ NCBI Protein |
| 文献 | ✅ PubMed | ✅ PubMed |
| 变异 | ✅ ClinVar/gnomAD | ❌ |
| 临床试验 | ✅ ClinicalTrials | ❌ |
| 序列信息 | ✅ | ✅ 更详细 |
最佳实践：
- 快速基因查询 → BioMCP（MyGene.info）
- 详细基因信息 → NCBI Gene
- 变异分析 → BioMCP（ClinVar/gnomAD）
- 临床试验 → BioMCP
💡 使用示例
1. 查询基因信息
用户: "查一下TP53基因"
操作: BioMCP搜索 "TP53" 或 NCBI Gene搜索
2. 变异分析
用户: "TP53的致病突变有哪些"
操作: BioMCP查询 ClinVar 变异
3. 搜索文献
用户: "找几篇关于CRISPR的论文"
操作: PubMed搜索 "CRISPR"
4. 临床试验
用户: "乳腺癌相关的临床试验"
操作: ClinicalTrials查询 "breast cancer"
📊 支持的数据源
| 数据源 | 类型 | 内容 |
|---|
| NCBI Gene | 基因数据库 | 基因信息、序列 |
| NCBI Protein | 蛋白质数据库 | 蛋白质序列、结构 |
| PubMed | 文献数据库 | 生物医学文献 |
| ClinVar | 变异数据库 | 致病性变异 |
| gnomAD | 变异数据库 | 人群变异频率 |
| ClinicalTrials.gov | 临床试验 | 全球临床试验 |
| MyGene.info | 基因API | 快速基因查询 |
| UniProt | 蛋白质数据库 | 蛋白质注释 |
🎯 触发场景
- 用户询问基因、蛋白质信息
- 需要查询生物医学文献
- 需要分析基因变异
- 需要查找临床试验
- 生物信息学相关需求
🌐 相关资源
BioMCP + NCBI | 一站式生物信息学服务
