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Skills in diesem Repository

PKU-EMBL/Metagenomics-Skills - Seite 5

SkillsMP hat 163 Skills aus PKU-EMBL/Metagenomics-Skills gesammelt. Öffne einen Skill, um Quelle und Details zu prüfen.

PKU-EMBL/Metagenomics-Skills

Es werden 3 von 163 gesammelten Skills angezeigt.

Beruf
Softwareentwickler
Beschreibung

Protein-coding gene prediction; use -p meta for metagenomes. Use this skill when working with prodigal: installing, choosing parameters, running commands, interpreting outputs, or troubleshooting. Upstream: https://github.com/hyattpd/Prodigal. For routing…

Quellsprache: Englisch

Aktualisiert
Beruf
Softwareentwickler
Beschreibung

Fetch and cite public shotgun metagenomic reads from NCBI SRA and EBI ENA. Use this skill when: (1) Downloading public metagenomes by SRR/ERR/DRR, (2) Resolving BioProject/Study accessions, (3) Choosing fasterq-dump vs ena-ftp / Aspera, (4) Building manifests…

Quellsprache: Englisch

Aktualisiert
Beruf
Sonstige Biowissenschaftler
Beschreibung

Viral sequence identification from metagenomic assemblies. Use this skill when working with virsorter2: installing, choosing parameters, running commands, interpreting outputs, or troubleshooting. Upstream: https://github.com/jiarong/VirSorter2. For routing…

Quellsprache: Englisch

Aktualisiert
Es werden 3 von 163 gesammelten Skills angezeigt.