evidence-research

# 科研证据调研 先选择最小充分模式，再核验来源身份、正文论断和当前项目适用性。搜索结果片段与二手转述只用于发现候选来源。 ## 1. 选择工作模式 ### Rapid verification 用于单个事实、单篇引文、DOI/PMID、标题或少量依据。执行： 1. 按 [references/source-routing.md](references/source-routing.md) 选择主源； 2. 核对题名、作者、年份、期刊、DOI/PMID 及更正或撤稿关联； 3. 需要引用具体结论时打开摘要或全文核对原句语境； 4. 输出简短结论、来源标识、核验层级和未核验项。 Rapid 模式不强制预先登记检索方案或建立完整证据汇总表。题名、作者、期刊等信息正确，不等于正文中的具体论断已经核验。 ### Formal evidence review 用于结局指标、量表、异常值规则、新方法、多个候选方案或跨领域应用。执行完整流程：明确问题 → 预先登记检索方案 → 分层检索 → 核验来源 → 汇总证据 → 判断证据能否直接回答当前问题及能否用于当前人群或场景 → 记录方法选择及依据。 定义不清的分组、终点、纳排或主分析方法先问用户，文献不能替用户决定研究口径。 ## 2. 核验来源身份 读取 [references/source-routing.md](references/source-routing.md)。可用确定性脚本核验 DOI、PMID 或标题： ```bash python scripts/verify_sources.py "10.xxxx/xxxx" python scripts/verify_sources.py "12345678" "article title" --pretty ``` 脚本通过 PubMed E-utilities 与 Crossref 核对元数据和更正/撤稿关系，输出 `evidence_id`、`metadata_verified`、`full_text_status`、`claim_verified` 与 `retrieved_at`。网络失败或来源冲突保留未核验状态并返回非零退出码；不得用脚本的元数据结果替代全文论断核验。 无法取得全文或无法核对关键结论时标记“未核验”，不得作为正式论断依据。发现 DOI/PMID 冲突、撤稿或来源不明时剔除或降级，并记录原因。 需要为论文、研究报告或专项统计分析选择报告规范时，完整读取 [科研报告规范选择](references/reporting-guideline-routing.md)。先按研究设计选择基础规范，再叠加实际实施的方法和数据采集规范；不得因变量名称相似而自动采用专项清单，也不得用单一清单覆盖所有研究设计。 ## 3. Formal 检索协议 仅 formal 模式在检索前填写 [references/search-protocol.md](references/search-protocol.md)： 1. 数据库、权威网站、检索日期与覆盖时间； 2. 逐库检索式、语言、人群、研究类型和全文纳排条件； 3. 去重、筛选方法和停止条件。 保留奠基方法论文，同时重点检索近 3–5 年的指南、验证、更新和系统综述。“最新”不等于只取最近文章。 ## 4. 组织证据 按问题组合证据层级： - 指南、标准与共识用于定义规范和报告要求； - 系统综述与 Meta 分析用于总体证据与异质性； - 奠基方法论文用于方法定义、假设和估计目标； - 目标领域验证研究用于性能、复现性和适用人群； - 相邻领域研究仅作间接证据，必须降低论断强度。 Formal 模式按 [references/evidence-matrix.md](references/evidence-matrix.md) 一条来源一行提取。每条来源使用脚本生成或人工确定的稳定 `evidence_id`；在 `DECISIONS.md` 的方法决策中引用这些 ID，形成“证据 → 变量/指标/模型选择”的可追溯链。 来源不一致时比较人群、定义、测量、模型、时间窗和偏倚，不按篇数投票。 ## 5. 跨领域可迁移性评估 逐项判断： 1. 构念是否相同，而非名称相似； 2. 测量尺度、采样过程与数据生成机制是否兼容； 3. 方法假设能否在目标数据中检验； 4. 能否做内部验证、校准或复现； 5. 间接性如何降低论断强度。 关键项无法判断时，只登记为隔离验证候选，不直接并入主流程。文献只能说明合理范围或核查方向，不能单独证明某个观测值应改成多少。 ## 6. 输出与衔接 Rapid 输出：核验对象、来源身份、元数据状态、全文/论断状态、更正或撤稿关系及简短结论。 Formal 输出：检索方案、来源清单、证据汇总表、候选方案比较、证据与当前问题的直接相关程度和适用性、与证据相符的论断强度、建议采用的方案及所引用的 `evidence_id`。 进入分析时把方法假设和验证要求交给 `biostat-principles`，再按项目主语言交给 `r-biostats` 或 `python-biostats`；进入写作时把已核验引文和证据边界交给 `academic-publishing`。本 skill 不代跑模型，也不代写论文正文。