初始化标准卫生统计研究或咨询项目,默认生成 R 七层目录,也可按用户明确选择生成 Python 目录,并创建 PROTOCOL、SAP、结果单源、registry 与可选 Git 配置。仅在用户明确要求创建项目或把空工作区建成正式项目时使用;简单作业、快速核验和已有项目分析不触发。上游为 biostat-principles;咨询项目完成分析后再用 consulting-delivery。
Python 流行病学与生物统计分析的可选执行层,仅用于用户明确要求 Python,或既有项目已经以 Python 为主流程时的数据清洗、描述统计、回归、生存分析、预测验证、统计表图、代码调试和结果复现。开工先遵循 biostat-principles;统计图配合 publication-figures,客户外发再用 consulting-delivery。未指定语言的普通统计分析、R 环境或依赖缺失、研究设计定稿、论文写作或仅操作 xlsx 文件不触发。
R 流行病学与生物统计的主要执行层,用于 R 数据清洗、描述统计、回归、生存、中介、Meta 分析、统计表图和代码调试;用户未指定语言且无既有语言合同时也使用。开工先遵循 biostat-principles;统计图配合 publication-figures,客户外发再用 consulting-delivery。不用于已明确采用 Python 的分析、研究设计定稿或论文写作。
基于已验证的代码、结果单源和表图生成或结构性重写中英文期刊论文、学位论文部件、摘要、题名、cover letter、审稿回复、highlights 和投稿正式往来,并做投稿前一致性自查。开工先用 biostat-principles,终审用 academic-humanizer;实际 Word 操作再配合 docx。已有文本的局部润色或压缩只用 academic-humanizer。
流行病学与生物统计的上游行为原则,用于研究设计、R/Python 分析、论文、咨询交付和项目审查开工前,以及口径争议、结果不一致或试新方法时。提供原始数据只读、最小实现、可验证目标、结果追溯、复现、异常闭环和隔离实验规则;轻量任务不因此升级为正式项目。
把已完成并验证的 R 或 Python 分析打包为客户可独立复现、可直接阅读且保留真实溯源的咨询交付物。用于“给客户交付”“打包结果”或在 05_reports/ 建正式结果包;不用于未完成分析或内部探索。上游为 biostat-principles,文本终审配合 academic-humanizer,签发配合 epi-project-audit。
科研决策的证据检索、来源身份核验、证据评价与适用性判断技能。触发场景:(1) 快速核验单个事实、单篇引文、标题、DOI 或 PMID;(2) 查找最新证据、指南、方法依据或真实引文;(3) 构建结局指标、选择量表、制定异常值规则;(4) 试新方法、比较指标或判断跨领域方法能否迁移。 自动选择 rapid verification 或 formal evidence review。两种模式均核验来源身份;只有 formal 模式强制完整检索协议和证据矩阵。不负责统计模型实跑或论文正文生成,不得以文献替代项目数据核验,不得编造来源或研究结论。
为 R 或 Python 真实数据选择、绘制、返工和审查发表级统计图、数据图,包括森林图、生存曲线、ROC、热图和模型诊断,并控制尺寸、字体、配色与多面板。任何 ggplot/matplotlib 统计出图均使用;流程、机制、框架和技术路线转 research-visuals。上游为 biostat-principles。