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Skills neste repositório

eightmm/codex-science - Página 2

O SkillsMP coletou 420 skills de eightmm/codex-science. Abra uma skill para revisar a origem e os detalhes.

eightmm/codex-science

Mostrando 40 de 420 skills coletadas.

ocupação
Cientistas médicos (exceto epidemiologistas)
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Synthesize public cancer genomic alterations across genes, cohorts, molecular profiles, clinical annotations, and literature. Use for somatic landscape, biomarker, resistance, or translational oncology research.

Idioma do texto original: inglês

atualizado
ocupação
Cientistas médicos (exceto epidemiologistas)
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Resolve cancer genes and plan public cBioPortal cohort queries. Use for somatic alteration, cancer cohort, co-alteration, survival, or translational oncology evidence.

Idioma do texto original: inglês

atualizado
ocupação
Bioquímicos e biofísicos
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Resolve chemical entities, ontology identifiers, formulae, and structures through ChEBI. Use before chemistry, metabolite, reaction, or pharmacology workflows when names or identifiers are ambiguous.

Idioma do texto original: inglês

atualizado
ocupação
Cientistas biológicos, todos os outros
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Reconcile gene expression across GTEx, Human Protein Atlas, Bgee, cell atlases, and disease datasets. Use for tissue, cell-type, developmental, baseline-versus-disease, or target-expression questions.

Idioma do texto original: inglês

atualizado
ocupação
Cientistas biológicos, todos os outros
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Assess rare-variant gene burden evidence with explicit cohort, ancestry, mask, frequency threshold, model, phenotype, and multiple-testing semantics. Use for gene-level human genetic support and locus-to-gene follow-up.

Idioma do texto original: inglês

atualizado
ocupação
Cientistas biológicos, todos os outros
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Resolve traits and discover curated human genetic association evidence with GWAS Catalog REST API v2. Use for trait, locus, variant, ancestry, study, and locus-to-gene research.

Idioma do texto original: inglês

atualizado
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Cientistas biológicos, todos os outros
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Integrate public metabolite, reaction, protein, proteomics, and study evidence. Use for pathway mechanism, biomarker context, multi-omics follow-up, or dataset selection.

Idioma do texto original: inglês

atualizado
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Cientistas biológicos, todos os outros
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Discover public microbiome and metagenomics studies through MGnify. Use for biome, sample, assembly, taxonomic, functional, or public microbiome dataset questions.

Idioma do texto original: inglês

atualizado
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Cientistas biológicos, todos os outros
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Normalize human gene symbols and aliases to Entrez, Ensembl, and taxonomic identifiers with MyGene.info. Use before cross-database gene, target, expression, or variant research when identifiers are incomplete or inconsistent.

Idioma do texto original: inglês

atualizado
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Cientistas biológicos, todos os outros
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Resolve human genes through NCBI Entrez Gene and preserve links to sequence, literature, variation, and GEO resources. Use for NCBI-centered gene and identifier research.

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atualizado
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Cientistas biológicos, todos os outros
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Run bounded NCBI-centered research across Gene, PubMed/PMC, sequence, variation, and GEO-linked records. Use when a gene, accession, sequence, or literature question requires traceable NCBI cross-links.

Idioma do texto original: inglês

atualizado
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Cientistas biológicos, todos os outros
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Compare one normalized variant across FinnGen, BioBank Japan, and UKB/TOPMed PheWAS evidence. Use for phenotype-wide replication, ancestry heterogeneity, pleiotropy screening, or cohort comparison.

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atualizado
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Cientistas biológicos, todos os outros
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Discover public proteomics projects through PRIDE Archive. Use for mass-spectrometry datasets, reanalysis candidates, protein evidence, or public-study discovery.

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atualizado
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Cientistas biológicos, todos os outros
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Resolve a known PXD accession through ProteomeXchange. Use for cross-repository accession verification and proteomics reanalysis planning; use PRIDE for keyword discovery.

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atualizado
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Search curated biochemical reactions and participants through Rhea. Use for enzyme, pathway, metabolite, reaction-direction, or mechanism context.

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Resolve non-coding RNA identifiers, sequences, types, and cross-references through RNAcentral. Use for RNA annotation, accession normalization, ncRNA, or sequence-context research.

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atualizado
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Cientistas biológicos, todos os outros
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Find ontology-aware healthy wild-type gene expression context with Bgee. Use for cross-species, anatomical, developmental-stage, or baseline-expression questions.

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atualizado
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Cientistas biológicos, todos os outros
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Normalize genes, proteins, variants, diseases, phenotypes, compounds, reactions, tissues, cell types, organisms, studies, and accessions before multi-source biomedical research. Use whenever aliases, assemblies, releases, or identifier namespaces could change…

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Cientistas biológicos, todos os outros
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Reconcile conflicting multi-source biomedical evidence with explicit entity, release, cohort, assay, independence, and claim semantics. Use before final conclusions from multiple databases or evidence lanes.

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Cientistas biológicos, todos os outros
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Discover public life-science studies and associated archive records through EMBL-EBI BioStudies. Use for ArrayExpress, supplementary-data, accession, and public dataset discovery.

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atualizado
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Cientistas médicos (exceto epidemiologistas)
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Synthesize public cancer genomic alterations across genes, cohorts, molecular profiles, clinical annotations, and literature. Use for somatic landscape, biomarker, resistance, or translational oncology research.

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Cientistas médicos (exceto epidemiologistas)
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Resolve cancer genes and plan public cBioPortal cohort queries. Use for somatic alteration, cancer cohort, co-alteration, survival, or translational oncology evidence.

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Cientistas biológicos, todos os outros
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Resolve chemical entities, ontology identifiers, formulae, and structures through ChEBI. Use before chemistry, metabolite, reaction, or pharmacology workflows when names or identifiers are ambiguous.

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atualizado
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Cientistas biológicos, todos os outros
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Reconcile gene expression across GTEx, Human Protein Atlas, Bgee, cell atlases, and disease datasets. Use for tissue, cell-type, developmental, baseline-versus-disease, or target-expression questions.

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atualizado
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Desenvolvedores de software
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Assess rare-variant gene burden evidence with explicit cohort, ancestry, mask, frequency threshold, model, phenotype, and multiple-testing semantics. Use for gene-level human genetic support and locus-to-gene follow-up.

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Desenvolvedores de software
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Resolve traits and discover curated human genetic association evidence with GWAS Catalog REST API v2. Use for trait, locus, variant, ancestry, study, and locus-to-gene research.

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Desenvolvedores de software
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Route broad or multi-step life-science questions into normalized entities, the smallest independent evidence lanes, reproducible retrieval, conflict reconciliation, and review. Use for target, variant, disease, omics, structure, pharmacology, clinical, or…

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atualizado
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Desenvolvedores de software
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Prioritize candidate genes at human genetic loci using curated association, credible-set/L2G, colocalization, eQTL, coding, burden, expression, and pathway evidence. Use for GWAS follow-up and target prioritization.

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Desenvolvedores de software
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Integrate public metabolite, reaction, protein, proteomics, and study evidence. Use for pathway mechanism, biomarker context, multi-omics follow-up, or dataset selection.

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atualizado
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Desenvolvedores de software
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Discover public microbiome and metagenomics studies through MGnify. Use for biome, sample, assembly, taxonomic, functional, or public microbiome dataset questions.

Idioma do texto original: inglês

atualizado
ocupação
Desenvolvedores de software
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Normalize human gene symbols and aliases to Entrez, Ensembl, and taxonomic identifiers with MyGene.info. Use before cross-database gene, target, expression, or variant research when identifiers are incomplete or inconsistent.

Idioma do texto original: inglês

atualizado
ocupação
Desenvolvedores de software
descrição

Resolve human genes through NCBI Entrez Gene and preserve links to sequence, literature, variation, and GEO resources. Use for NCBI-centered gene and identifier research.

Idioma do texto original: inglês

atualizado
ocupação
Desenvolvedores de software
descrição

Run bounded NCBI-centered research across Gene, PubMed/PMC, sequence, variation, and GEO-linked records. Use when a gene, accession, sequence, or literature question requires traceable NCBI cross-links.

Idioma do texto original: inglês

atualizado
ocupação
Desenvolvedores de software
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Compare one normalized variant across FinnGen, BioBank Japan, and UKB/TOPMed PheWAS evidence. Use for phenotype-wide replication, ancestry heterogeneity, pleiotropy screening, or cohort comparison.

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Cientistas biológicos, todos os outros
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Discover public proteomics projects through PRIDE Archive. Use for mass-spectrometry datasets, reanalysis candidates, protein evidence, or public-study discovery.

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Cientistas biológicos, todos os outros
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Resolve a known PXD accession through ProteomeXchange. Use for cross-repository accession verification and proteomics reanalysis planning; use PRIDE for keyword discovery.

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Cientistas biológicos, todos os outros
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Discover and triage reusable public transcriptomics, proteomics, metabolomics, microbiome, and supplementary-study datasets. Use when a research question needs external data rather than only literature.

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Cientistas biológicos, todos os outros
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Search curated biochemical reactions and participants through Rhea. Use for enzyme, pathway, metabolite, reaction-direction, or mechanism context.

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Cientistas biológicos, todos os outros
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Resolve non-coding RNA identifiers, sequences, types, and cross-references through RNAcentral. Use for RNA annotation, accession normalization, ncRNA, or sequence-context research.

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Cientistas médicos (exceto epidemiologistas)
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Synthesize target, ligand, mechanism, exposure, safety, pharmacogenomic, trial, and regulatory evidence for translational pharmacology questions. Use for target-drug-indication landscapes, not prescribing.

Idioma do texto original: inglês

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Mostrando 40 de 420 skills coletadas.