microbe
Use when the user has a 16S or ITS feature table plus taxonomy and metadata and needs alpha/beta diversity, composition bars, differential abundance, co-occurrence networks, random-forest biomarkers, or a taxonomy tree. Drive the microbe MCP tools with local Rscript.
معلومات المصدر
- المستودع
- MiniMax-AI/MiniMax-Code-Plugins
- آخر نشاط في المصدر
- ٢٥ أغسطس ٢٠٢٦ في ٠٢:٥٢
- لغة SKILL.md المكتشفة
- الإنجليزية
- النجوم
- ١٨
- التفرعات
- ١٣
خيارات التثبيت
يُحدَّد Prompt الذي يراجع المصدر أولًا بشكل افتراضي. يمكنك التبديل إلى أمر مباشر أو تنزيل نسخة محلية.
مراجعة ملفات المصدر
اقرأ SKILL.md وأي ملفات مرافقة يعرضها SkillsMP قبل أن تقرر التثبيت.
عرض SKILL.md
SKILL.md
تعليمات المصدر · معاينة للقراءة فقط- name
- microbe
- description
- Use when the user has a 16S or ITS feature table plus taxonomy and metadata and needs alpha/beta diversity, composition bars, differential abundance, co-occurrence networks, random-forest biomarkers, or a taxonomy tree. Drive the microbe MCP tools with local Rscript.
# microbe
Use the `microbe` MCP tools. Do not reimplement vegan/DESeq2 plots in Python.
## Typical order
1. `microbe_env`
2. `microbe_alpha`, `microbe_beta`
3. `microbe_composition`, `microbe_diff`
4. `microbe_network`, `microbe_rf`, `microbe_corr`, `microbe_tree` as requested
Expected columns: `feature_id` + sample counts; taxonomy ranks or a QIIME semicolon string; `sample_name` + `group`.
Missing R or packages: return the tool's repair command. This Plugin does not go from raw reads to ASVs.
عرض على GitHub