microbe
Use when the user has a 16S or ITS feature table plus taxonomy and metadata and needs alpha/beta diversity, composition bars, differential abundance, co-occurrence networks, random-forest biomarkers, or a taxonomy tree. Drive the microbe MCP tools with local Rscript.
소스 정보
- 저장소
- MiniMax-AI/MiniMax-Code-Plugins
- 최근 소스 활동
- 2026년 8월 25일 02:52
- 감지된 SKILL.md 언어
- 영어
- 스타
- 18
- 포크
- 13
설치 방법
기본적으로 소스를 먼저 확인하는 Prompt가 선택됩니다. 직접 명령으로 전환하거나 로컬 사본을 다운로드할 수도 있습니다.
소스 파일 검토
설치 여부를 결정하기 전에 SKILL.md와 SkillsMP에 표시된 보조 파일을 읽어 보세요.
SKILL.md 표시 중
SKILL.md
소스 지침 · 읽기 전용 미리보기- name
- microbe
- description
- Use when the user has a 16S or ITS feature table plus taxonomy and metadata and needs alpha/beta diversity, composition bars, differential abundance, co-occurrence networks, random-forest biomarkers, or a taxonomy tree. Drive the microbe MCP tools with local Rscript.
# microbe
Use the `microbe` MCP tools. Do not reimplement vegan/DESeq2 plots in Python.
## Typical order
1. `microbe_env`
2. `microbe_alpha`, `microbe_beta`
3. `microbe_composition`, `microbe_diff`
4. `microbe_network`, `microbe_rf`, `microbe_corr`, `microbe_tree` as requested
Expected columns: `feature_id` + sample counts; taxonomy ranks or a QIIME semicolon string; `sample_name` + `group`.
Missing R or packages: return the tool's repair command. This Plugin does not go from raw reads to ASVs.
GitHub에서 보기