microbe
Use when the user has a 16S or ITS feature table plus taxonomy and metadata and needs alpha/beta diversity, composition bars, differential abundance, co-occurrence networks, random-forest biomarkers, or a taxonomy tree. Drive the microbe MCP tools with local Rscript.
ソース情報
- リポジトリ
- MiniMax-AI/MiniMax-Code-Plugins
- ソースの最終更新活動
- 2026年8月25日 02:52
- 検出された SKILL.md の言語
- 英語
- スター
- 18
- フォーク
- 13
インストール方法
デフォルトでは、最初にソースを確認する Prompt が選択されています。直接コマンドに切り替えるか、ローカルコピーをダウンロードすることもできます。
ソースファイルを確認
インストールを決める前に、SKILL.md と SkillsMP に表示されている付属ファイルをお読みください。
SKILL.md を表示中
SKILL.md
ソースの指示 · 読み取り専用プレビュー- name
- microbe
- description
- Use when the user has a 16S or ITS feature table plus taxonomy and metadata and needs alpha/beta diversity, composition bars, differential abundance, co-occurrence networks, random-forest biomarkers, or a taxonomy tree. Drive the microbe MCP tools with local Rscript.
# microbe
Use the `microbe` MCP tools. Do not reimplement vegan/DESeq2 plots in Python.
## Typical order
1. `microbe_env`
2. `microbe_alpha`, `microbe_beta`
3. `microbe_composition`, `microbe_diff`
4. `microbe_network`, `microbe_rf`, `microbe_corr`, `microbe_tree` as requested
Expected columns: `feature_id` + sample counts; taxonomy ranks or a QIIME semicolon string; `sample_name` + `group`.
Missing R or packages: return the tool's repair command. This Plugin does not go from raw reads to ASVs.
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